RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623635.1

PTPRQ-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-210ENST00000623635 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
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PTPRQ-210ENST00000623635 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-0.04□□□□□ -2.42
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