RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		6.16	□□□□□ -1.42
FAM200B-223	ENST00000622362	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		6.16	□□□□□ -1.42
FAM200B-223	ENST00000622362	XP32	Q5T750	250 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		6.05	□□□□□ -1.44
FAM200B-223	ENST00000622362	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		6.05	□□□□□ -1.44
FAM200B-223	ENST00000622362	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		6.02	□□□□□ -1.45
FAM200B-223	ENST00000622362	DNHD1	Q96M86	4753 aa		5.99	□□□□□ -1.45
FAM200B-223	ENST00000622362	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		5.99	□□□□□ -1.45
FAM200B-223	ENST00000622362	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		5.98	□□□□□ -1.45
FAM200B-223	ENST00000622362	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		5.98	□□□□□ -1.45
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1B0GVY2	172 aa		5.97	□□□□□ -1.45
FAM200B-223	ENST00000622362	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		5.96	□□□□□ -1.45
FAM200B-223	ENST00000622362	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.92	□□□□□ -1.46
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP12-2	P59991	146 aa		5.91	□□□□□ -1.46
FAM200B-223	ENST00000622362	PKHD1	P08F94	4074 aa		5.9	□□□□□ -1.46
FAM200B-223	ENST00000622362	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5.81	□□□□□ -1.48
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP10-10	P60014	251 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		5.71	□□□□□ -1.49
FAM200B-223	ENST00000622362	TNXB	P22105	4242 aa		5.69	□□□□□ -1.5
FAM200B-223	ENST00000622362	HSPG2	P98160	4391 aa		5.68	□□□□□ -1.5
FAM200B-223	ENST00000622362	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		5.63	□□□□□ -1.51
FAM200B-223	ENST00000622362	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		5.62	□□□□□ -1.51
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
FAM200B-223	ENST00000622362	RYR2	Q92736	4967 aa		5.58	□□□□□ -1.52
FAM200B-223	ENST00000622362	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		5.57	□□□□□ -1.52
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.56	□□□□□ -1.52
FAM200B-223	ENST00000622362	FAT1	Q14517	4588 aa		5.56	□□□□□ -1.52
FAM200B-223	ENST00000622362	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
FAM200B-223	ENST00000622362	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		5.43	□□□□□ -1.54
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		5.37	□□□□□ -1.55
FAM200B-223	ENST00000622362	INE1	O15225	51 aa		5.33	□□□□□ -1.56
FAM200B-223	ENST00000622362	RYR3	Q15413	4870 aa		5.32	□□□□□ -1.56
FAM200B-223	ENST00000622362	LPA	P08519	4548 aa		5.31	□□□□□ -1.56
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.3	□□□□□ -1.56
FAM200B-223	ENST00000622362	RYR1	P21817	5038 aa		5.29	□□□□□ -1.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MYCBP2	O75592	4640 aa		5.29	□□□□□ -1.56
FAM200B-223	ENST00000622362	MUC17	Q685J3	4493 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FAM200B-223	ENST00000622362	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP10-12	P60413	245 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FAM200B-223	ENST00000622362	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM200B-223	ENST00000622362	LRP2	P98164	4655 aa		5.09	□□□□□ -1.6
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM200B-223	ENST00000622362	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM200B-223	ENST00000622362	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM200B-223	ENST00000622362	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM200B-223	ENST00000622362	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM200B-223	ENST00000622362	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.02	□□□□□ -1.61
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM200B-223	ENST00000622362	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM200B-223	ENST00000622362	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM200B-223	ENST00000622362	HERC2	O95714	4834 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM200B-223	ENST00000622362	HERC1	Q15751	4861 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FAM200B-223	ENST00000622362	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FAM200B-223	ENST00000622362	MUC2	Q02817	5179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM200B-223	ENST00000622362	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM200B-223	ENST00000622362	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.5	□□□□□ -1.69
FAM200B-223	ENST00000622362	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FAM200B-223	ENST00000622362	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
FAM200B-223	ENST00000622362	MT2A	P02795	61 aa		4.45	□□□□□ -1.7
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.42	□□□□□ -1.7
FAM200B-223	ENST00000622362	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.4	□□□□□ -1.7
FAM200B-223	ENST00000622362	MT1H	P80294	61 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM200B-223	ENST00000622362	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM200B-223	ENST00000622362	MT1F	P04733	61 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM200B-223	ENST00000622362	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM200B-223	ENST00000622362	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.27	□□□□□ -1.73
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.23	□□□□□ -1.73
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.22	□□□□□ -1.73
FAM200B-223	ENST00000622362	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FAM200B-223	ENST00000622362	MT1B	P07438	61 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM200B-223	ENST00000622362	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM200B-223	ENST00000622362	MT1X	P80297	61 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-223	ENST00000622362	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.05	□□□□□ -1.76
FAM200B-223	ENST00000622362	MT1G	P13640	62 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FAM200B-223	ENST00000622362	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.93	□□□□□ -1.78
FAM200B-223	ENST00000622362	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.9	□□□□□ -1.78
FAM200B-223	ENST00000622362	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.88	□□□□□ -1.79
FAM200B-223	ENST00000622362	LCE2B	O14633	110 aa		3.85	□□□□□ -1.79
FAM200B-223	ENST00000622362	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
FAM200B-223	ENST00000622362	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM200B-223	ENST00000622362	SPRR2E	P22531	72 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM200B-223	ENST00000622362	SPRR2B	P35325	72 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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