RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.75□□□□□ -1.49
UBXN8-209ENST00000620074 PDE6GP18545 87 aa5.74□□□□□ -1.49
UBXN8-209ENST00000620074 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.74□□□□□ -1.49
UBXN8-209ENST00000620074 Q6ZQT0 140 aa5.74□□□□□ -1.49
UBXN8-209ENST00000620074 A0A1B0GVX0 72 aa5.73□□□□□ -1.49
UBXN8-209ENST00000620074 C20orf197Q8N268 126 aa5.73□□□□□ -1.49
UBXN8-209ENST00000620074 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.7□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 M0R2T5 61 aa5.69□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 OCR1Q9BZK8 76 aa5.69□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 hDV103S1A0JD37 113 aa5.68□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 NDUFB1O75438 58 aa5.68□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 HCG22E2RYF7 251 aa5.67□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.67□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.67□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 A8MWP4 228 aa5.66□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 K7ERS5 55 aa5.66□□□□□ -1.5
UBXN8-209ENST00000620074 NREPQ16612 68 aa5.64□□□□□ -1.51
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.63□□□□□ -1.51
UBXN8-209ENST00000620074 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.62□□□□□ -1.51
UBXN8-209ENST00000620074 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.62□□□□□ -1.51
UBXN8-209ENST00000620074 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
UBXN8-209ENST00000620074 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.62□□□□□ -1.51
UBXN8-209ENST00000620074 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
UBXN8-209ENST00000620074 HRES1P13985 223 aa5.59□□□□□ -1.51
UBXN8-209ENST00000620074 CASC2Q6XLA1 102 aa5.59□□□□□ -1.51
UBXN8-209ENST00000620074 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.58□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.57□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 LUZP6Q538Z0 58 aa5.56□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 PRAC1Q96KF2 57 aa5.56□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.55□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 Q5VV11 94 aa5.55□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.55□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 K7EQZ3 153 aa5.54□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 BPY2O14599 106 aa5.54□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 SPINK7P58062 85 aa5.54□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 A6NED7 52 aa5.53□□□□□ -1.52
UBXN8-209ENST00000620074 ROMO1P60602 79 aa5.52□□□□□ -1.53
UBXN8-209ENST00000620074 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.49□□□□□ -1.53
UBXN8-209ENST00000620074 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.48□□□□□ -1.53
UBXN8-209ENST00000620074 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.47□□□□□ -1.53
UBXN8-209ENST00000620074 UBL5Q9BZL1 73 aa5.47□□□□□ -1.53
UBXN8-209ENST00000620074 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.46□□□□□ -1.54
UBXN8-209ENST00000620074 LINC00846Q9NV44 126 aa5.46□□□□□ -1.54
UBXN8-209ENST00000620074 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.45□□□□□ -1.54
UBXN8-209ENST00000620074 Q8N9L7 120 aa5.45□□□□□ -1.54
UBXN8-209ENST00000620074 SNURFQ9Y675 71 aa5.44□□□□□ -1.54
UBXN8-209ENST00000620074 A0A087WVE0 104 aa5.42□□□□□ -1.54
UBXN8-209ENST00000620074 MT2AP02795 61 aa5.4□□□□□ -1.54
UBXN8-209ENST00000620074 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.39□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 IGKV2-30P06310 120 aa5.39□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.39□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 Q5W150 140 aa5.39□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.39□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 H3BPC8 53 aa5.37□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 MT1FP04733 61 aa5.36□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 PRR15LQ9BU68 103 aa5.36□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.35□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 USH2AO75445 5202 aa5.35□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP10-10P60014 251 aa5.34□□□□□ -1.55
UBXN8-209ENST00000620074 A8MU10 97 aa5.32□□□□□ -1.56
UBXN8-209ENST00000620074 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.31□□□□□ -1.56
UBXN8-209ENST00000620074 SSPOA2VEC9 5147 aa5.26□□□□□ -1.57
UBXN8-209ENST00000620074 CSAG1Q6PB30 78 aa5.25□□□□□ -1.57
UBXN8-209ENST00000620074 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.25□□□□□ -1.57
UBXN8-209ENST00000620074 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.23□□□□□ -1.57
UBXN8-209ENST00000620074 DMAC1Q96GE9 116 aa5.23□□□□□ -1.57
UBXN8-209ENST00000620074 LINC00208Q96KT6 92 aa5.2□□□□□ -1.58
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.19□□□□□ -1.58
UBXN8-209ENST00000620074 P0C880 135 aa5.18□□□□□ -1.58
UBXN8-209ENST00000620074 S4R3F8 94 aa5.18□□□□□ -1.58
UBXN8-209ENST00000620074 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.14□□□□□ -1.59
UBXN8-209ENST00000620074 H0Y9P7 68 aa5.12□□□□□ -1.59
UBXN8-209ENST00000620074 UQCR11O14957 56 aa5.11□□□□□ -1.59
UBXN8-209ENST00000620074 NDUFAF8A1L188 74 aa5.1□□□□□ -1.59
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.09□□□□□ -1.59
UBXN8-209ENST00000620074 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.05□□□□□ -1.6
UBXN8-209ENST00000620074 A0A1B0GU33 70 aa5.04□□□□□ -1.6
UBXN8-209ENST00000620074 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.99□□□□□ -1.61
UBXN8-209ENST00000620074 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
UBXN8-209ENST00000620074 H0YAA0 97 aa4.95□□□□□ -1.62
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.95□□□□□ -1.62
UBXN8-209ENST00000620074 COA5Q86WW8 74 aa4.95□□□□□ -1.62
UBXN8-209ENST00000620074 CRIPTQ9P021 101 aa4.95□□□□□ -1.62
UBXN8-209ENST00000620074 MT1BP07438 61 aa4.93□□□□□ -1.62
UBXN8-209ENST00000620074 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.92□□□□□ -1.62
UBXN8-209ENST00000620074 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.89□□□□□ -1.63
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.88□□□□□ -1.63
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP10-5P60370 271 aa4.83□□□□□ -1.64
UBXN8-209ENST00000620074 A0A1B0GU69 56 aa4.82□□□□□ -1.64
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.81□□□□□ -1.64
UBXN8-209ENST00000620074 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.81□□□□□ -1.64
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
UBXN8-209ENST00000620074 ACYP2P14621 99 aa4.76□□□□□ -1.65
UBXN8-209ENST00000620074 R4GN34 69 aa4.75□□□□□ -1.65
UBXN8-209ENST00000620074 M0QZ58 72 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.9 ms