RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BATFQ16520 125 aa3.94□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 Q5VV11 94 aa3.94□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CSAG1Q6PB30 78 aa3.94□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 Q8N9L7 120 aa3.93□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 S4R3F8 94 aa3.93□□□□□ -1.78
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UBL5Q9BZL1 73 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NEBP20929 6669 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A0A1W2PPM0 123 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IMUPQ9GZP8 106 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MT1BP07438 61 aa3.86□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LCA10Q71F78 164 aa3.86□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.86□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KLKP1Q107X0 134 aa3.85□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.85□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.85□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.85□□□□□ -1.79
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TAX1BP3O14907 124 aa3.83□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP10-5P60370 271 aa3.83□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.83□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NDUFAF8A1L188 74 aa3.82□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CRIPTQ9P021 101 aa3.82□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.79□□□□□ -1.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A0A1B0GV90 55 aa3.76□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP5-9P26371 169 aa3.76□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.76□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NDUFC1O43677 76 aa3.75□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.75□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.74□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.73□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.73□□□□□ -1.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 K7EP34 96 aa3.71□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.71□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.71□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRO0461Q9UI25 63 aa3.71□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KMT2DO14686 5537 aa3.71□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A0A087WVE0 104 aa3.7□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A8MUN3 132 aa3.7□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ACYP1P07311 99 aa3.7□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.7□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 H0YAA0 97 aa3.69□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLAC4Q8WY50 150 aa3.69□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATOX1O00244 68 aa3.68□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LCE1FQ5T754 118 aa3.68□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.68□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.68□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 F8W1H4 67 aa3.67□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPRR2EP22531 72 aa3.67□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPRR2BP35325 72 aa3.67□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPRR2AP35326 72 aa3.67□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MDN1Q9NU22 5596 aa3.67□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UQCRQO14949 82 aa3.66□□□□□ -1.82
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 H0Y9P7 68 aa3.65□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ETDBQ3ZM63 59 aa3.65□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.64□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C20orf197Q8N268 126 aa3.63□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 R4GN34 69 aa3.63□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.62□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MP68P56378 58 aa3.59□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MT1XP80297 61 aa3.59□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC00208Q96KT6 92 aa3.59□□□□□ -1.83
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 K7ERU9 68 aa3.58□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 M0QZ58 72 aa3.58□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP10-12P60413 245 aa3.58□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.58□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 OCR1Q9BZK8 76 aa3.58□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP12-2P59991 146 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC01554Q52M75 96 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LCE1EQ5T753 118 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPRR2DP22532 72 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 J3QR89 54 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 P0C880 135 aa3.52□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC00643Q86TS7 51 aa3.51□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MT-ATP8P03928 68 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SCGB1A1P11684 91 aa3.49□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 H3BPC8 53 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.48□□□□□ -1.85
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.46□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DMAC1Q96GE9 116 aa3.46□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.45□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.42□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ACYP2P14621 99 aa3.41□□□□□ -1.86
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.39□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.34□□□□□ -1.87
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 A8MU10 97 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SEC61GP60059 68 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SNURFQ9Y675 71 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MT1EP04732 61 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms