RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 COA5Q86WW8 74 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GVX0 72 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-209ENST00000607882 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFAF8A1L188 74 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-209ENST00000607882 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-209ENST00000607882 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-209ENST00000607882 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-209ENST00000607882 SPINK1P00995 79 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-209ENST00000607882 Q5W150 140 aa6.96□□□□□ -1.29
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RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-209ENST00000607882 C9orf92A6NGG3 77 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-209ENST00000607882 TPRXLQ17RH7 258 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-209ENST00000607882 XP32Q5T750 250 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-209ENST00000607882 ACYP2P14621 99 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MUU9 505 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-209ENST00000607882 DMAC1Q96GE9 116 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-209ENST00000607882 MUC17Q685J3 4493 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-209ENST00000607882 K7ERS5 55 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV2-30P06310 120 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.72□□□□□ -1.33
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RABGEF1-209ENST00000607882 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CRIPTQ9P021 101 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-209ENST00000607882 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-209ENST00000607882 UQCR11O14957 56 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE2CQ5TA81 110 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-209ENST00000607882 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MT1HP80294 61 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-209ENST00000607882 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-209ENST00000607882 M0R2T5 61 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-209ENST00000607882 H0YAA0 97 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GU33 70 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-209ENST00000607882 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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RABGEF1-209ENST00000607882 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1-209ENST00000607882 SSPOA2VEC9 5147 aa6.04□□□□□ -1.44
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RABGEF1-209ENST00000607882 S4R3F8 94 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-209ENST00000607882 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP12-2P59991 146 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-209ENST00000607882 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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RABGEF1-209ENST00000607882 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
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RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP10-5P60370 271 aa5.3□□□□□ -1.56
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RABGEF1-209ENST00000607882 PP632Q6XCG6 107 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-209ENST00000607882 MT1XP80297 61 aa5.21□□□□□ -1.57
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-209ENST00000607882 NEBP20929 6669 aa5.15□□□□□ -1.58
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RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.99□□□□□ -1.61
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