RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 ATXN8Q156A1 80 aa2.48□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.47□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.47□□□□□ -2.01
HERC3-212ENST00000597259 TAX1BP3O14907 124 aa2.46□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 NDUFB1O75438 58 aa2.46□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 MTURNQ8N3F0 131 aa2.46□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 M0R143 59 aa2.45□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 PDE6GP18545 87 aa2.45□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.45□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.44□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa2.44□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 MT1BP07438 61 aa2.44□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 SMIM6P0DI80 62 aa2.44□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 NREPQ16612 68 aa2.44□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 Q8N9L7 120 aa2.44□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 hDV103S1A0JD37 113 aa2.43□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.43□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 PP632Q6XCG6 107 aa2.43□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 A0A1W2PPM0 123 aa2.42□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 H3BT86 120 aa2.42□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.41□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 BPY2O14599 106 aa2.41□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 BATFQ16520 125 aa2.41□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 C4orf26Q17RF5 130 aa2.41□□□□□ -2.02
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.4□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.4□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.4□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 MDN1Q9NU22 5596 aa2.4□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 HCG22E2RYF7 251 aa2.39□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 CASC2Q6XLA1 102 aa2.39□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.39□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 LINC00846Q9NV44 126 aa2.39□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 TSTD3H0UI37 97 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 NDUFS5O43920 106 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 A0A087WVE0 104 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 KMT2DO14686 5537 aa2.37□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 C5orf47Q569G3 176 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 LCA10Q71F78 164 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.36□□□□□ -2.03
HERC3-212ENST00000597259 K7EP34 96 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 S4R3F8 94 aa2.33□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 A6NN06 94 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 Q5VV11 94 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.32□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 KLKP1Q107X0 134 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 CSAG1Q6PB30 78 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 UBL5Q9BZL1 73 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 ETDBQ3ZM63 59 aa2.29□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-212ENST00000597259 MT1XP80297 61 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-212ENST00000597259 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-212ENST00000597259 F8W1H4 67 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-212ENST00000597259 H0YAA0 97 aa2.24□□□□□ -2.05
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.24□□□□□ -2.05
HERC3-212ENST00000597259 CRIPTQ9P021 101 aa2.24□□□□□ -2.05
HERC3-212ENST00000597259 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.23□□□□□ -2.05
HERC3-212ENST00000597259 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa2.22□□□□□ -2.05
HERC3-212ENST00000597259 H0Y9P7 68 aa2.21□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.2□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 PCP4L1A6NKN8 68 aa2.2□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 P0C880 135 aa2.2□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 IMUPQ9GZP8 106 aa2.2□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 UQCRQO14949 82 aa2.19□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.19□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 ACYP1P07311 99 aa2.18□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa2.18□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.18□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 NDUFC1O43677 76 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 A8MUN3 132 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 ATOX1O00244 68 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 SPRR2EP22531 72 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 SPRR2BP35325 72 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 SPRR2AP35326 72 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 LINC00208Q96KT6 92 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-212ENST00000597259 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 LINC00643Q86TS7 51 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 DMAC1Q96GE9 116 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 A0A1B0GV90 55 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 PLAC4Q8WY50 150 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 M0QZ58 72 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 R4GN34 69 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 MP68P56378 58 aa2.09□□□□□ -2.07
HERC3-212ENST00000597259 H3BPC8 53 aa2.08□□□□□ -2.08
HERC3-212ENST00000597259 SPRR2DP22532 72 aa2.08□□□□□ -2.08
HERC3-212ENST00000597259 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.08□□□□□ -2.08
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.06□□□□□ -2.08
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms