RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP6Q13023 2319 aa1.41□□□□□ -2.18
PTPRM-204ENST00000577468 MXRA5Q9NR99 2828 aa1.41□□□□□ -2.18
PTPRM-204ENST00000577468 HTN1P15515 57 aa1.41□□□□□ -2.18
PTPRM-204ENST00000577468 TLN2Q9Y4G6 2542 aa1.4□□□□□ -2.18
PTPRM-204ENST00000577468 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa1.4□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 PRO0255Q9UI72 69 aa1.4□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 CSMD2Q7Z408 3487 aa1.4□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa1.4□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 HIVEP2P31629 2446 aa1.39□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 TGP01266 2768 aa1.39□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa1.39□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 S4R3F8 94 aa1.39□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 SONP18583 2426 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa1.38□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 RYR1P21817 5038 aa1.38□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1109Q2LD37 5005 aa1.38□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 SPINK1P00995 79 aa1.38□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 TENM2Q9NT68 2774 aa1.37□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 ZANQ9Y493 2812 aa1.37□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa1.36□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 Q5VSD8 79 aa1.36□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 HYDINQ4G0P3 5121 aa1.36□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 MGAM2Q2M2H8 2515 aa1.36□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 ROS1P08922 2347 aa1.35□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 VWFP04275 2813 aa1.35□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 TENM1Q9UKZ4 2725 aa1.34□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.34□□□□□ -2.19
PTPRM-204ENST00000577468 BSNQ9UPA5 3926 aa1.34□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0D9SG42 100 aa1.32□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP12-1P59990 96 aa1.32□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB136Q30KP8 78 aa1.32□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP9Q99996 3911 aa1.32□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 MUC2Q02817 5179 aa1.32□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 H3BNG1 76 aa1.31□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 M0QZ58 72 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 RYR2Q92736 4967 aa1.29□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 HERC2O95714 4834 aa1.28□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01556Q5JQF7 62 aa1.28□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 TENM3Q9P273 2699 aa1.28□□□□□ -2.2
PTPRM-204ENST00000577468 VPS13CQ709C8 3753 aa1.28□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 VPS13DQ5THJ4 4388 aa1.27□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 CUBNO60494 3623 aa1.27□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 A0A096LPF7 62 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP10-10P60014 251 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 STAB2Q8WWQ8 2551 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 SVEP1Q4LDE5 3571 aa1.24□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 A0A096LNI7 61 aa1.24□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 SPINK6Q6UWN8 80 aa1.24□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 SPART-AS1P0CW21 52 aa1.23□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 COL7A1Q02388 2944 aa1.22□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 ABCA13Q86UQ4 5058 aa1.22□□□□□ -2.21
PTPRM-204ENST00000577468 HERC1Q15751 4861 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH11Q96DT5 4516 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 ANK2Q01484 3957 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 FSIP2Q5CZC0 6907 aa1.2□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 RPS29P62273 56 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.17□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 FAT4Q6V0I7 4981 aa1.15□□□□□ -2.22
PTPRM-204ENST00000577468 TNP1P09430 55 aa1.15□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP12-4P60329 112 aa1.15□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 CRCT1Q9UGL9 99 aa1.15□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 FRAS1Q86XX4 4008 aa1.15□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH8Q96JB1 4490 aa1.14□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 MYCBP2O75592 4640 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 HTN3P15516 51 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 C9orf92A6NGG3 77 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 NEBP20929 6669 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.11□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 CSMD3Q7Z407 3707 aa1.11□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB4AO15263 64 aa1.11□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB135Q30KP9 77 aa1.11□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.11□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH3Q8TD57 4116 aa1.11□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH2Q9P225 4427 aa1.11□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 SACSQ9NZJ4 4579 aa1.11□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 LYSTQ99698 3801 aa1.09□□□□□ -2.23
PTPRM-204ENST00000577468 CMYA5Q8N3K9 4069 aa1.09□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH1Q9P2D7 4330 aa1.09□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH7Q8WXX0 4024 aa1.08□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 DNAH10Q8IVF4 4471 aa1.07□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa1.06□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 KMT2AQ03164 3969 aa1.06□□□□□ -2.24
PTPRM-204ENST00000577468 RNF213Q63HN8 5207 aa1.06□□□□□ -2.24
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