RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AKAP13-223	ENST00000560957	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
AKAP13-223	ENST00000560957	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		0.16	□□□□□ -2.38
AKAP13-223	ENST00000560957	LRP2	P98164	4655 aa		0.15	□□□□□ -2.38
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		0.15	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	COL6A5	A8TX70	2615 aa		0.15	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		0.15	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		0.15	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMA1	P25391	3075 aa		0.15	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		0.14	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		0.14	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRK2	Q5S007	2527 aa		0.14	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		0.13	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		0.13	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	ACACB	O00763	2458 aa		0.12	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		0.12	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	ACACA	Q13085	2346 aa		0.12	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		0.11	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		0.1	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		0.1	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		0.09	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		0.09	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	LEAP2	Q969E1	77 aa		0.08	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		0.08	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		0.08	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		0.08	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	SPG11	Q96JI7	2443 aa		0.07	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		0.07	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		0.06	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	MGA	Q8IWI9	3026 aa		0.06	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.06	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM186A	A6NE01	2351 aa		0.06	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMA3	Q16787	3333 aa		0.05	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	RELN	P78509	3460 aa		0.05	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		0.05	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB1	P60022	68 aa		0.04	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	MT1H	P80294	61 aa		0.04	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	0.03	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		0.03	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		0.03	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf42	Q9H799	3197 aa		0.03	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	FAT1	Q14517	4588 aa		0.03	□□□□□ -2.4
AKAP13-223	ENST00000560957	SSPO	A2VEC9	5147 aa		0.01	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	0.01	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP54	Q96N23	3096 aa		0.01	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		0.01	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		0.01	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		0	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	PRCD	Q00LT1	54 aa		0	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		0	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	-0	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	MT1E	P04732	61 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957		K7EIM0	57 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC2	Q02817	5179 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB136	Q30KP8	78 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC17	Q685J3	4493 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	LRBA	P50851	2863 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	ATM	Q13315	3056 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	MT1L	Q93083	61 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		-0.1	□□□□□ -2.42
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BUX3	64 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	MT1X	P80297	61 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	FRYL	O94915	3013 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	HERC1	Q15751	4861 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		-0.11	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		-0.11	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS13C	Q709C8	3753 aa		-0.11	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	-0.12	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		-0.12	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	ITPR2	Q14571	2701 aa		-0.13	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC3A	Q02505	3323 aa		-0.13	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB124	Q8NES8	71 aa		-0.13	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		-0.13	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		-0.14	□□□□□ -2.43
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		-0.14	□□□□□ -2.43

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