RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	PDE6G	P18545	87 aa		4.33	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A087WSZ3	146 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1B0GW54	56 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6ZQT0	140 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ABCD4-222	ENST00000555617		F8W1H4	67 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ABCD4-222	ENST00000555617		J3QR89	54 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ABCD4-222	ENST00000555617		J3KT08	172 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00313	P59037	77 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ABCD4-222	ENST00000555617	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ABCD4-222	ENST00000555617	NREP	Q16612	68 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	MT1E	P04732	61 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	LCA10	Q71F78	164 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1B0GVX0	72 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	NDUFB1	O75438	58 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6ZVQ6	151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ABCD4-222	ENST00000555617	BPY2	O14599	106 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617		H0YAA0	97 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617	ACYP1	P07311	99 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617		K7EQZ3	153 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617	CXCL6	P80162	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617	MT1M	Q8N339	61 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617		Q8N9L7	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617	MT1G	P13640	62 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ABCD4-222	ENST00000555617	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ABCD4-222	ENST00000555617	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ABCD4-222	ENST00000555617	NDUFS5	O43920	106 aa		4	□□□□□ -1.77
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ABCD4-222	ENST00000555617		Q5W150	140 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ABCD4-222	ENST00000555617	CSAG1	Q6PB30	78 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ABCD4-222	ENST00000555617	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ABCD4-222	ENST00000555617	MT-ATP8	P03928	68 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ABCD4-222	ENST00000555617	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
ABCD4-222	ENST00000555617	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A087WVE0	104 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ABCD4-222	ENST00000555617	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617		S4R3F8	94 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC179	H3BU77	68 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	UQCRQ	O14949	82 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617		A8MUN3	132 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	OCR1	Q9BZK8	76 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	ATOX1	O00244	68 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM258	P61165	79 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	C4orf26	Q17RF5	130 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ABCD4-222	ENST00000555617		H0Y9P7	68 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ABCD4-222	ENST00000555617	COX7C	P15954	63 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ABCD4-222	ENST00000555617	MP68	P56378	58 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ABCD4-222	ENST00000555617	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ABCD4-222	ENST00000555617		H3BPC8	53 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ABCD4-222	ENST00000555617	MT1L	Q93083	61 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00208	Q96KT6	92 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ABCD4-222	ENST00000555617	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCD4-222	ENST00000555617	SERP2	Q8N6R1	65 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCD4-222	ENST00000555617		V9GYY9	64 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ABCD4-222	ENST00000555617	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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