RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-217ENST00000550044 UBL5Q9BZL1 73 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-217ENST00000550044 NDUFS5O43920 106 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-217ENST00000550044 HRES1P13985 223 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-217ENST00000550044 SPINK7P58062 85 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-217ENST00000550044 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-217ENST00000550044 FAM236CP0DP71 79 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-217ENST00000550044 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-217ENST00000550044 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-217ENST00000550044 CASC2Q6XLA1 102 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-217ENST00000550044 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-217ENST00000550044 HCG22E2RYF7 251 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-217ENST00000550044 Q5W150 140 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-217ENST00000550044 NEBP20929 6669 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GV90 55 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-217ENST00000550044 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-217ENST00000550044 ACYP1P07311 99 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-217ENST00000550044 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-217ENST00000550044 PSPHP1O15172 72 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-217ENST00000550044 MT2AP02795 61 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-217ENST00000550044 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-217ENST00000550044 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-217ENST00000550044 MT1FP04733 61 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-217ENST00000550044 C4orf26Q17RF5 130 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-217ENST00000550044 PRO0628Q9UI54 55 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-217ENST00000550044 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CS-217ENST00000550044 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-217ENST00000550044 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-217ENST00000550044 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-217ENST00000550044 KRTAP10-10P60014 251 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-217ENST00000550044 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-217ENST00000550044 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-217ENST00000550044 LINC00643Q86TS7 51 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-217ENST00000550044 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-217ENST00000550044 A0A087WVE0 104 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-217ENST00000550044 J3QR89 54 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-217ENST00000550044 MT3P25713 68 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-217ENST00000550044 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-217ENST00000550044 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-217ENST00000550044 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-217ENST00000550044 UQCRQO14949 82 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-217ENST00000550044 H0Y9P7 68 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-217ENST00000550044 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-217ENST00000550044 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-217ENST00000550044 KRTAP10-5P60370 271 aa4.53□□□□□ -1.68
CS-217ENST00000550044 S4R3F8 94 aa4.52□□□□□ -1.69
CS-217ENST00000550044 ATOX1O00244 68 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-217ENST00000550044 LCA10Q71F78 164 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-217ENST00000550044 LINC00208Q96KT6 92 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-217ENST00000550044 MDN1Q9NU22 5596 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-217ENST00000550044 MP68P56378 58 aa4.48□□□□□ -1.69
CS-217ENST00000550044 CSAG1Q6PB30 78 aa4.48□□□□□ -1.69
CS-217ENST00000550044 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.47□□□□□ -1.69
CS-217ENST00000550044 SCGB1A1P11684 91 aa4.47□□□□□ -1.69
CS-217ENST00000550044 K7ERU9 68 aa4.46□□□□□ -1.7
CS-217ENST00000550044 KLKP1Q107X0 134 aa4.46□□□□□ -1.7
CS-217ENST00000550044 MT-ATP8P03928 68 aa4.45□□□□□ -1.7
CS-217ENST00000550044 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.43□□□□□ -1.7
CS-217ENST00000550044 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.43□□□□□ -1.7
CS-217ENST00000550044 KMT2DO14686 5537 aa4.42□□□□□ -1.7
CS-217ENST00000550044 IMUPQ9GZP8 106 aa4.42□□□□□ -1.7
CS-217ENST00000550044 H3BPC8 53 aa4.39□□□□□ -1.71
CS-217ENST00000550044 NDUFC1O43677 76 aa4.38□□□□□ -1.71
CS-217ENST00000550044 A8MUN3 132 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-217ENST00000550044 PMAIP1Q13794 54 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-217ENST00000550044 LUZP6Q538Z0 58 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-217ENST00000550044 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-217ENST00000550044 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-217ENST00000550044 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.34□□□□□ -1.71
CS-217ENST00000550044 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.33□□□□□ -1.72
CS-217ENST00000550044 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.33□□□□□ -1.72
CS-217ENST00000550044 A6NN06 94 aa4.32□□□□□ -1.72
CS-217ENST00000550044 DMAC1Q96GE9 116 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-217ENST00000550044 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-217ENST00000550044 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-217ENST00000550044 SNURFQ9Y675 71 aa4.28□□□□□ -1.72
CS-217ENST00000550044 H0YAA0 97 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 MT1BP07438 61 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 K7ERS5 55 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 Q5VV11 94 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.25□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 CRIPTQ9P021 101 aa4.25□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 ACYP2P14621 99 aa4.24□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 C20orf197Q8N268 126 aa4.23□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 SERP2Q8N6R1 65 aa4.23□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.22□□□□□ -1.73
CS-217ENST00000550044 P0C880 135 aa4.2□□□□□ -1.74
CS-217ENST00000550044 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.2□□□□□ -1.74
CS-217ENST00000550044 SPRR2EP22531 72 aa4.19□□□□□ -1.74
CS-217ENST00000550044 SPRR2BP35325 72 aa4.19□□□□□ -1.74
CS-217ENST00000550044 SPRR2AP35326 72 aa4.19□□□□□ -1.74
CS-217ENST00000550044 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-217ENST00000550044 KRTAP10-12P60413 245 aa4.16□□□□□ -1.74
CS-217ENST00000550044 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.15□□□□□ -1.75
CS-217ENST00000550044 R4GN34 69 aa4.15□□□□□ -1.75
CS-217ENST00000550044 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.14□□□□□ -1.75
CS-217ENST00000550044 A6NED7 52 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-217ENST00000550044 M0QZ58 72 aa4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms