RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 SPRR2AP35326 72 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-214ENST00000548849 SMIM6P0DI80 62 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-214ENST00000548849 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-214ENST00000548849 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-214ENST00000548849 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-214ENST00000548849 NDUFC1O43677 76 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-214ENST00000548849 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-214ENST00000548849 H0YAA0 97 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 A8MUN3 132 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 MT1XP80297 61 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 K7EP34 96 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 PLAC4Q8WY50 150 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 PRO0461Q9UI25 63 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-214ENST00000548849 SPRR2DP22532 72 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-214ENST00000548849 ACYP1P07311 99 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-214ENST00000548849 KRTAP12-2P59991 146 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-214ENST00000548849 H0Y9P7 68 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-214ENST00000548849 R4GN34 69 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-214ENST00000548849 ATOX1O00244 68 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-214ENST00000548849 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-214ENST00000548849 UQCRQO14949 82 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-214ENST00000548849 ETDBQ3ZM63 59 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-214ENST00000548849 F8W1H4 67 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-214ENST00000548849 M0QZ58 72 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-214ENST00000548849 P0C880 135 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-214ENST00000548849 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-214ENST00000548849 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-214ENST00000548849 LCE3BQ5TA77 95 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-214ENST00000548849 C20orf197Q8N268 126 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-214ENST00000548849 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-214ENST00000548849 LINC01554Q52M75 96 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-214ENST00000548849 LINC00208Q96KT6 92 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-214ENST00000548849 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-214ENST00000548849 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-214ENST00000548849 KRTAP10-12P60413 245 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-214ENST00000548849 MP68P56378 58 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-214ENST00000548849 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-214ENST00000548849 OCR1Q9BZK8 76 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-214ENST00000548849 DMAC1Q96GE9 116 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-214ENST00000548849 MT-ATP8P03928 68 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-214ENST00000548849 LINC00643Q86TS7 51 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-214ENST00000548849 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-214ENST00000548849 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-214ENST00000548849 H3BPC8 53 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-214ENST00000548849 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-214ENST00000548849 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-214ENST00000548849 ACYP2P14621 99 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-214ENST00000548849 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-214ENST00000548849 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-214ENST00000548849 SCGB1A1P11684 91 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-214ENST00000548849 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-214ENST00000548849 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-214ENST00000548849 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-214ENST00000548849 MT1EP04732 61 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-214ENST00000548849 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-214ENST00000548849 H3BS24 57 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-214ENST00000548849 LCE1DQ5T752 114 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-214ENST00000548849 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-214ENST00000548849 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-214ENST00000548849 MT4P47944 62 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-214ENST00000548849 MT1GP13640 62 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-214ENST00000548849 LCE4AQ5TA78 99 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-214ENST00000548849 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-214ENST00000548849 J3QR89 54 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-214ENST00000548849 A0A0D9SG42 100 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-214ENST00000548849 PP632Q6XCG6 107 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-214ENST00000548849 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GV90 55 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-214ENST00000548849 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-214ENST00000548849 MT1MQ8N339 61 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-214ENST00000548849 SNURFQ9Y675 71 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-214ENST00000548849 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-214ENST00000548849 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-214ENST00000548849 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-214ENST00000548849 MT1LQ93083 61 aa6□□□□□ -1.45
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-214ENST00000548849 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-214ENST00000548849 SEC61GP60059 68 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-214ENST00000548849 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-214ENST00000548849 SVIPQ8NHG7 77 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-214ENST00000548849 KRTAP12-1P59990 96 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GU33 70 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-214ENST00000548849 COA5Q86WW8 74 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-214ENST00000548849 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-214ENST00000548849 LCE3AQ5TA76 89 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-214ENST00000548849 SERP2Q8N6R1 65 aa5.77□□□□□ -1.49
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