RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 A8MUN3 132 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-205ENST00000547715 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1W2PNM2 257 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-205ENST00000547715 DSCR10P59022 87 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-205ENST00000547715 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-205ENST00000547715 MT2AP02795 61 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-205ENST00000547715 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-205ENST00000547715 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-205ENST00000547715 A6NED7 52 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-205ENST00000547715 A6NN06 94 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-205ENST00000547715 K7EQZ3 153 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-205ENST00000547715 LCA10Q71F78 164 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-205ENST00000547715 PRR15LQ9BU68 103 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-205ENST00000547715 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-205ENST00000547715 H0Y9P7 68 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-205ENST00000547715 MT1FP04733 61 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-205ENST00000547715 CASC2Q6XLA1 102 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP10-10P60014 251 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-205ENST00000547715 COA5Q86WW8 74 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-205ENST00000547715 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-205ENST00000547715 A8MWP4 228 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-205ENST00000547715 Q96NJ1 140 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-205ENST00000547715 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-205ENST00000547715 IGFL1Q6UW32 110 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-205ENST00000547715 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-205ENST00000547715 A8MUU9 505 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-205ENST00000547715 A0A087WSZ3 146 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-205ENST00000547715 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-205ENST00000547715 C8orf87E5RJ46 101 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-205ENST00000547715 NEBP20929 6669 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-205ENST00000547715 ACYP2P14621 99 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-205ENST00000547715 HRES1P13985 223 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-205ENST00000547715 LINC01554Q52M75 96 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-205ENST00000547715 A8MU10 97 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-205ENST00000547715 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-205ENST00000547715 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-205ENST00000547715 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00313P59037 77 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-205ENST00000547715 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-205ENST00000547715 SPINK7P58062 85 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-205ENST00000547715 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1B0GVX0 72 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRB-205ENST00000547715 MUC12Q9UKN1 5478 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-205ENST00000547715 UQCR11O14957 56 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1B0GU69 56 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-205ENST00000547715 DMAC1Q96GE9 116 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-205ENST00000547715 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-205ENST00000547715 PRAC1Q96KF2 57 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-205ENST00000547715 MDN1Q9NU22 5596 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-205ENST00000547715 IGKV2-30P06310 120 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-205ENST00000547715 KMT2DO14686 5537 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-205ENST00000547715 Q5W150 140 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-205ENST00000547715 CSAG1Q6PB30 78 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP5-9P26371 169 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-205ENST00000547715 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-205ENST00000547715 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-205ENST00000547715 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-205ENST00000547715 K7ERS5 55 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-205ENST00000547715 MT1BP07438 61 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-205ENST00000547715 ROMO1P60602 79 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP10-5P60370 271 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-205ENST00000547715 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1B0GU33 70 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-205ENST00000547715 SPRR2EP22531 72 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-205ENST00000547715 SPRR2BP35325 72 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-205ENST00000547715 SPRR2AP35326 72 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-205ENST00000547715 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-205ENST00000547715 H0YAA0 97 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-205ENST00000547715 S4R3F8 94 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-205ENST00000547715 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-205ENST00000547715 SPRR2DP22532 72 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-205ENST00000547715 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRB-205ENST00000547715 P0C880 135 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-205ENST00000547715 A0A0A0MQY5 61 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRB-205ENST00000547715 CRIPTQ9P021 101 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRB-205ENST00000547715 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-205ENST00000547715 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-205ENST00000547715 LCE3BQ5TA77 95 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-205ENST00000547715 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-205ENST00000547715 MT1XP80297 61 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-205ENST00000547715 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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