RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 A0A1B0GU69 56 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-204ENST00000546621 PCOTHQ58A44 107 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-204ENST00000546621 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-204ENST00000546621 ACYP2P14621 99 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-204ENST00000546621 HERC2O95714 4834 aa4.53□□□□□ -1.68
CS-204ENST00000546621 Q96NJ1 140 aa4.53□□□□□ -1.68
CS-204ENST00000546621 FAT1Q14517 4588 aa4.52□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 RYR1P21817 5038 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 P0C880 135 aa4.48□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 DMAC1Q96GE9 116 aa4.48□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 CDK2AP2O75956 126 aa4.47□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 A0A1B0GVX0 72 aa4.46□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.46□□□□□ -1.69
CS-204ENST00000546621 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.46□□□□□ -1.7
CS-204ENST00000546621 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
CS-204ENST00000546621 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.46□□□□□ -1.7
CS-204ENST00000546621 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.45□□□□□ -1.7
CS-204ENST00000546621 HSPG2P98160 4391 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-204ENST00000546621 A8MUU9 505 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-204ENST00000546621 SPINK1P00995 79 aa4.41□□□□□ -1.7
CS-204ENST00000546621 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.41□□□□□ -1.7
CS-204ENST00000546621 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.4□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.4□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.39□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 Q5VSD8 79 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 TNXBP22105 4242 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 Q5W150 140 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.34□□□□□ -1.71
CS-204ENST00000546621 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.33□□□□□ -1.72
CS-204ENST00000546621 K7ERS5 55 aa4.31□□□□□ -1.72
CS-204ENST00000546621 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CS-204ENST00000546621 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
CS-204ENST00000546621 NDUFAF8A1L188 74 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-204ENST00000546621 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-204ENST00000546621 KRTAP10-8P60410 259 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-204ENST00000546621 Q8N1X5 172 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-204ENST00000546621 LUZP6Q538Z0 58 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-204ENST00000546621 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-204ENST00000546621 H0YAA0 97 aa4.25□□□□□ -1.73
CS-204ENST00000546621 IGKV2-30P06310 120 aa4.25□□□□□ -1.73
CS-204ENST00000546621 HERC1Q15751 4861 aa4.24□□□□□ -1.73
CS-204ENST00000546621 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.23□□□□□ -1.73
CS-204ENST00000546621 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CS-204ENST00000546621 C9orf92A6NGG3 77 aa4.22□□□□□ -1.73
CS-204ENST00000546621 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
CS-204ENST00000546621 MYCBP2O75592 4640 aa4.2□□□□□ -1.74
CS-204ENST00000546621 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.2□□□□□ -1.74
CS-204ENST00000546621 MT1HL1P0DM35 61 aa4.2□□□□□ -1.74
CS-204ENST00000546621 A0A1B0GU33 70 aa4.16□□□□□ -1.74
CS-204ENST00000546621 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.15□□□□□ -1.75
CS-204ENST00000546621 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.15□□□□□ -1.75
CS-204ENST00000546621 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.11□□□□□ -1.75
CS-204ENST00000546621 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CS-204ENST00000546621 TPRXLQ17RH7 258 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-204ENST00000546621 CRIPTQ9P021 101 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-204ENST00000546621 LPAP08519 4548 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-204ENST00000546621 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4□□□□□ -1.77
CS-204ENST00000546621 LRP2P98164 4655 aa4□□□□□ -1.77
CS-204ENST00000546621 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-204ENST00000546621 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-204ENST00000546621 MUC17Q685J3 4493 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-204ENST00000546621 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-204ENST00000546621 RNF213Q63HN8 5207 aa3.88□□□□□ -1.79
CS-204ENST00000546621 S4R3F8 94 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-204ENST00000546621 PLAC4Q8WY50 150 aa3.84□□□□□ -1.8
CS-204ENST00000546621 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-204ENST00000546621 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CS-204ENST00000546621 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.79□□□□□ -1.8
CS-204ENST00000546621 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.78□□□□□ -1.8
CS-204ENST00000546621 A0A0D9SG42 100 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-204ENST00000546621 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-204ENST00000546621 KRTAP12-2P59991 146 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-204ENST00000546621 MUC2Q02817 5179 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-204ENST00000546621 KRTAP12-1P59990 96 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-204ENST00000546621 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-204ENST00000546621 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.66□□□□□ -1.82
CS-204ENST00000546621 PP632Q6XCG6 107 aa3.65□□□□□ -1.82
CS-204ENST00000546621 INE1O15225 51 aa3.65□□□□□ -1.83
CS-204ENST00000546621 M0QZ58 72 aa3.63□□□□□ -1.83
CS-204ENST00000546621 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-204ENST00000546621 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-204ENST00000546621 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-204ENST00000546621 R4GN34 69 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-204ENST00000546621 MT1HP80294 61 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-204ENST00000546621 M0R2T5 61 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-204ENST00000546621 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-204ENST00000546621 MT2AP02795 61 aa3.41□□□□□ -1.86
CS-204ENST00000546621 MT1FP04733 61 aa3.4□□□□□ -1.86
CS-204ENST00000546621 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.39□□□□□ -1.87
CS-204ENST00000546621 KRTAP10-10P60014 251 aa3.39□□□□□ -1.87
CS-204ENST00000546621 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CS-204ENST00000546621 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
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