RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.3□□□□□ -1.88
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR15LQ9BU68 103 aa3.3□□□□□ -1.88
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1W2PNM2 257 aa3.29□□□□□ -1.88
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.29□□□□□ -1.88
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 P0C880 135 aa3.28□□□□□ -1.88
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.28□□□□□ -1.88
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A087WSZ3 146 aa3.27□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0G2JQZ4 141 aa3.27□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPINK1P00995 79 aa3.27□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.27□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.27□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MT3P25713 68 aa3.27□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSAG1Q6PB30 78 aa3.26□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.26□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.25□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BPY2O14599 106 aa3.25□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDUFB1O75438 58 aa3.24□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.24□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.24□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.24□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.24□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GVX0 72 aa3.23□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGKV4-1P06312 121 aa3.23□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP10-8P60410 259 aa3.22□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNXBP22105 4242 aa3.22□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.22□□□□□ -1.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.2□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A8MUU9 505 aa3.19□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.19□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HERC2O95714 4834 aa3.18□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H3BPC8 53 aa3.18□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00208Q96KT6 92 aa3.18□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q96NJ1 140 aa3.18□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DSCR10P59022 87 aa3.17□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 K7EQZ3 153 aa3.16□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPINK7P58062 85 aa3.16□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.16□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MT1HL1P0DM35 61 aa3.16□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q8N9L7 120 aa3.16□□□□□ -1.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDUFAF8A1L188 74 aa3.15□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.14□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.14□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYCBP2O75592 4640 aa3.14□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.12□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DMAC1Q96GE9 116 aa3.12□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.11□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.11□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C9orf92A6NGG3 77 aa3.1□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H0Y9P7 68 aa3.1□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.1□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.1□□□□□ -1.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q5W150 140 aa3.07□□□□□ -1.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.07□□□□□ -1.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.07□□□□□ -1.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UQCR11O14957 56 aa3.06□□□□□ -1.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP10-5P60370 271 aa3.06□□□□□ -1.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPRXLQ17RH7 258 aa3.06□□□□□ -1.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.06□□□□□ -1.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COA5Q86WW8 74 aa3.06□□□□□ -1.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.05□□□□□ -1.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GU33 70 aa3.02□□□□□ -1.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.02□□□□□ -1.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.98□□□□□ -1.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LPAP08519 4548 aa2.97□□□□□ -1.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCOTHQ58A44 107 aa2.96□□□□□ -1.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MUC17Q685J3 4493 aa2.96□□□□□ -1.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.96□□□□□ -1.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HERC1Q15751 4861 aa2.94□□□□□ -1.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRP2P98164 4655 aa2.93□□□□□ -1.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GU69 56 aa2.92□□□□□ -1.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LCE1FQ5T754 118 aa2.92□□□□□ -1.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HRES1P13985 223 aa2.9□□□□□ -1.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.9□□□□□ -1.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.9□□□□□ -1.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACYP2P14621 99 aa2.89□□□□□ -1.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP10-12P60413 245 aa2.87□□□□□ -1.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.87□□□□□ -1.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.83□□□□□ -1.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 R4GN34 69 aa2.82□□□□□ -1.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.82□□□□□ -1.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 S4R3F8 94 aa2.81□□□□□ -1.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF213Q63HN8 5207 aa2.78□□□□□ -1.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.76□□□□□ -1.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.75□□□□□ -1.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 M0R2T5 61 aa2.74□□□□□ -1.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MUC2Q02817 5179 aa2.71□□□□□ -1.98
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.71□□□□□ -1.98
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CRIPTQ9P021 101 aa2.7□□□□□ -1.98
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INE1O15225 51 aa2.68□□□□□ -1.98
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.68□□□□□ -1.98
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MT1HP80294 61 aa2.67□□□□□ -1.98
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