RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496703.1

ITGB5-210, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB5, Length 789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-210ENST00000496703 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ITGB5-210ENST00000496703 KLKP1Q107X0 134 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB5-210ENST00000496703 LINC00208Q96KT6 92 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB5-210ENST00000496703 J3QR89 54 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-210ENST00000496703 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.26□□□□□ -1.25
ITGB5-210ENST00000496703 MT1BP07438 61 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGB5-210ENST00000496703 MP68P56378 58 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGB5-210ENST00000496703 A8MUN3 132 aa7.18□□□□□ -1.26
ITGB5-210ENST00000496703 NDUFC1O43677 76 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGB5-210ENST00000496703 Q5VV11 94 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGB5-210ENST00000496703 IMUPQ9GZP8 106 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB5-210ENST00000496703 MT-ATP8P03928 68 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB5-210ENST00000496703 SCGB1A1P11684 91 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB5-210ENST00000496703 H3BPC8 53 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGB5-210ENST00000496703 H0YAA0 97 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGB5-210ENST00000496703 CRIPTQ9P021 101 aa7.09□□□□□ -1.27
ITGB5-210ENST00000496703 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGB5-210ENST00000496703 A6NN06 94 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGB5-210ENST00000496703 DMAC1Q96GE9 116 aa7.06□□□□□ -1.28
ITGB5-210ENST00000496703 K7ERU9 68 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP10-5P60370 271 aa7.03□□□□□ -1.28
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.98□□□□□ -1.29
ITGB5-210ENST00000496703 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.97□□□□□ -1.29
ITGB5-210ENST00000496703 P0C880 135 aa6.96□□□□□ -1.3
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.93□□□□□ -1.3
ITGB5-210ENST00000496703 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.92□□□□□ -1.3
ITGB5-210ENST00000496703 SNURFQ9Y675 71 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGB5-210ENST00000496703 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGB5-210ENST00000496703 ACYP2P14621 99 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGB5-210ENST00000496703 NEBP20929 6669 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-210ENST00000496703 R4GN34 69 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGB5-210ENST00000496703 M0QZ58 72 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB5-210ENST00000496703 MT1XP80297 61 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGB5-210ENST00000496703 C20orf197Q8N268 126 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGB5-210ENST00000496703 KMT2DO14686 5537 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGB5-210ENST00000496703 SERP2Q8N6R1 65 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGB5-210ENST00000496703 PLAC4Q8WY50 150 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP5-9P26371 169 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB5-210ENST00000496703 LINC01554Q52M75 96 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGB5-210ENST00000496703 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB5-210ENST00000496703 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGB5-210ENST00000496703 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB5-210ENST00000496703 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGB5-210ENST00000496703 MDN1Q9NU22 5596 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGB5-210ENST00000496703 COX7CP15954 63 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP12-2P59991 146 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGB5-210ENST00000496703 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.56□□□□□ -1.36
ITGB5-210ENST00000496703 COA5Q86WW8 74 aa6.55□□□□□ -1.36
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ITGB5-210ENST00000496703 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGB5-210ENST00000496703 H7BZZ5 65 aa6.49□□□□□ -1.37
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ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.42□□□□□ -1.38
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ITGB5-210ENST00000496703 SPRR2AP35326 72 aa6.4□□□□□ -1.38
ITGB5-210ENST00000496703 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.36□□□□□ -1.39
ITGB5-210ENST00000496703 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.35□□□□□ -1.39
ITGB5-210ENST00000496703 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGB5-210ENST00000496703 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.33□□□□□ -1.4
ITGB5-210ENST00000496703 SEC61GP60059 68 aa6.32□□□□□ -1.4
ITGB5-210ENST00000496703 A0A0D9SG42 100 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGB5-210ENST00000496703 CCDC179H3BU77 68 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGB5-210ENST00000496703 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGB5-210ENST00000496703 A0A1B0GU33 70 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP12-1P59990 96 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB5-210ENST00000496703 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB5-210ENST00000496703 SPRR2DP22532 72 aa6.18□□□□□ -1.42
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ITGB5-210ENST00000496703 A8MU10 97 aa6.12□□□□□ -1.43
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ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.07□□□□□ -1.44
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ITGB5-210ENST00000496703 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.01□□□□□ -1.45
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ITGB5-210ENST00000496703 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.96□□□□□ -1.46
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGB5-210ENST00000496703 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.93□□□□□ -1.46
ITGB5-210ENST00000496703 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ITGB5-210ENST00000496703 LCE3AQ5TA76 89 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGB5-210ENST00000496703 TNP1P09430 55 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGB5-210ENST00000496703 UQCR11O14957 56 aa5.8□□□□□ -1.48
ITGB5-210ENST00000496703 MT1GP13640 62 aa5.78□□□□□ -1.48
ITGB5-210ENST00000496703 MT1LQ93083 61 aa5.77□□□□□ -1.49
ITGB5-210ENST00000496703 MT1MQ8N339 61 aa5.73□□□□□ -1.49
ITGB5-210ENST00000496703 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.72□□□□□ -1.49
ITGB5-210ENST00000496703 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.72□□□□□ -1.49
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