RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.73□□□□□ -0.85
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TRDMT1-211ENST00000495022 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.71□□□□□ -0.86
TRDMT1-211ENST00000495022 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.71□□□□□ -0.86
TRDMT1-211ENST00000495022 H0YAA0 97 aa9.67□□□□□ -0.86
TRDMT1-211ENST00000495022 NDUFC1O43677 76 aa9.63□□□□□ -0.87
TRDMT1-211ENST00000495022 F8W1H4 67 aa9.58□□□□□ -0.88
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa9.58□□□□□ -0.88
TRDMT1-211ENST00000495022 ETDBQ3ZM63 59 aa9.58□□□□□ -0.88
TRDMT1-211ENST00000495022 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.58□□□□□ -0.88
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa9.58□□□□□ -0.88
TRDMT1-211ENST00000495022 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.56□□□□□ -0.88
TRDMT1-211ENST00000495022 A8MUN3 132 aa9.53□□□□□ -0.88
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TRDMT1-211ENST00000495022 ATOX1O00244 68 aa9.52□□□□□ -0.88
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TRDMT1-211ENST00000495022 UQCRQO14949 82 aa9.5□□□□□ -0.89
TRDMT1-211ENST00000495022 H0Y9P7 68 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDMT1-211ENST00000495022 ACYP1P07311 99 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRDMT1-211ENST00000495022 SPRR2BP35325 72 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDMT1-211ENST00000495022 SPRR2AP35326 72 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDMT1-211ENST00000495022 PLAC4Q8WY50 150 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDMT1-211ENST00000495022 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa9.39□□□□□ -0.91
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.36□□□□□ -0.91
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP12-2P59991 146 aa9.36□□□□□ -0.91
TRDMT1-211ENST00000495022 R4GN34 69 aa9.32□□□□□ -0.92
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE1AQ5T7P2 110 aa9.31□□□□□ -0.92
TRDMT1-211ENST00000495022 LINC00208Q96KT6 92 aa9.3□□□□□ -0.92
TRDMT1-211ENST00000495022 C20orf197Q8N268 126 aa9.28□□□□□ -0.92
TRDMT1-211ENST00000495022 P0C880 135 aa9.24□□□□□ -0.93
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa9.24□□□□□ -0.93
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa9.24□□□□□ -0.93
TRDMT1-211ENST00000495022 M0QZ58 72 aa9.22□□□□□ -0.93
TRDMT1-211ENST00000495022 MP68P56378 58 aa9.22□□□□□ -0.93
TRDMT1-211ENST00000495022 OCR1Q9BZK8 76 aa9.17□□□□□ -0.94
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.16□□□□□ -0.94
TRDMT1-211ENST00000495022 SPRR2DP22532 72 aa9.16□□□□□ -0.94
TRDMT1-211ENST00000495022 LINC00643Q86TS7 51 aa9.16□□□□□ -0.94
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.16□□□□□ -0.94
TRDMT1-211ENST00000495022 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.13□□□□□ -0.95
TRDMT1-211ENST00000495022 LINC01554Q52M75 96 aa9.09□□□□□ -0.95
TRDMT1-211ENST00000495022 DMAC1Q96GE9 116 aa9.09□□□□□ -0.95
TRDMT1-211ENST00000495022 H3BPC8 53 aa9.05□□□□□ -0.96
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP10-12P60413 245 aa9.02□□□□□ -0.97
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE3BQ5TA77 95 aa8.95□□□□□ -0.98
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.89□□□□□ -0.99
TRDMT1-211ENST00000495022 MT-ATP8P03928 68 aa8.85□□□□□ -0.99
TRDMT1-211ENST00000495022 SCGB1A1P11684 91 aa8.82□□□□□ -1
TRDMT1-211ENST00000495022 ACYP2P14621 99 aa8.79□□□□□ -1
TRDMT1-211ENST00000495022 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.77□□□□□ -1.01
TRDMT1-211ENST00000495022 J3QR89 54 aa8.67□□□□□ -1.02
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1B0GV90 55 aa8.61□□□□□ -1.03
TRDMT1-211ENST00000495022 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.61□□□□□ -1.03
TRDMT1-211ENST00000495022 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR98Q8WXG9 6306 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDMT1-211ENST00000495022 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.52□□□□□ -1.05
TRDMT1-211ENST00000495022 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDMT1-211ENST00000495022 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.5□□□□□ -1.05
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.44□□□□□ -1.06
TRDMT1-211ENST00000495022 MT1EP04732 61 aa8.43□□□□□ -1.06
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDMT1-211ENST00000495022 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDMT1-211ENST00000495022 SNURFQ9Y675 71 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDMT1-211ENST00000495022 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A0D9SG42 100 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDMT1-211ENST00000495022 MT1GP13640 62 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE1DQ5T752 114 aa8.18□□□□□ -1.1
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.17□□□□□ -1.1
TRDMT1-211ENST00000495022 K7ERU9 68 aa8.15□□□□□ -1.1
TRDMT1-211ENST00000495022 PP632Q6XCG6 107 aa8.15□□□□□ -1.1
TRDMT1-211ENST00000495022 SEC61GP60059 68 aa8.13□□□□□ -1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 COA5Q86WW8 74 aa8.12□□□□□ -1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.12□□□□□ -1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 HMCN1Q96RW7 5635 aa8.11□□□□□ -1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE4AQ5TA78 99 aa8.1□□□□□ -1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.1□□□□□ -1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.1□□□□□ -1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 SERP2Q8N6R1 65 aa8.1□□□□□ -1.11
TRDMT1-211ENST00000495022 MT1MQ8N339 61 aa8.05□□□□□ -1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP12-1P59990 96 aa8.03□□□□□ -1.12
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1B0GU33 70 aa8.02□□□□□ -1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 MT4P47944 62 aa8.02□□□□□ -1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 MT1LQ93083 61 aa7.99□□□□□ -1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.95□□□□□ -1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.89□□□□□ -1.15
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.84□□□□□ -1.16
TRDMT1-211ENST00000495022 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.84□□□□□ -1.16
TRDMT1-211ENST00000495022 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.82□□□□□ -1.16
TRDMT1-211ENST00000495022 LCE3AQ5TA76 89 aa7.82□□□□□ -1.16
TRDMT1-211ENST00000495022 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.78□□□□□ -1.16
TRDMT1-211ENST00000495022 TNP1P09430 55 aa7.76□□□□□ -1.17
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