RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494120.1

C1orf109-211, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C1orf109, Length 2,570 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-211ENST00000494120 HSPG2P98160 4391 aa7.92□□□□□ -1.14
C1orf109-211ENST00000494120 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
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C1orf109-211ENST00000494120 MYCBP2O75592 4640 aa7.87□□□□□ -1.15
C1orf109-211ENST00000494120 TNXBP22105 4242 aa7.86□□□□□ -1.15
C1orf109-211ENST00000494120 CRIPTQ9P021 101 aa7.84□□□□□ -1.15
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C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
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C1orf109-211ENST00000494120 A0A0D9SG42 100 aa7.74□□□□□ -1.17
C1orf109-211ENST00000494120 ROMO1P60602 79 aa7.73□□□□□ -1.17
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C1orf109-211ENST00000494120 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.52□□□□□ -1.21
C1orf109-211ENST00000494120 RYR3Q15413 4870 aa7.5□□□□□ -1.21
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C1orf109-211ENST00000494120 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.46□□□□□ -1.21
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP12-1P59990 96 aa7.45□□□□□ -1.22
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C1orf109-211ENST00000494120 NDUFAF8A1L188 74 aa7.16□□□□□ -1.26
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C1orf109-211ENST00000494120 MUC17Q685J3 4493 aa7.14□□□□□ -1.27
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C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.07□□□□□ -1.28
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C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.02□□□□□ -1.29
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C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.38□□□□□ -1.39
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C1orf109-211ENST00000494120 MT1HP80294 61 aa6.23□□□□□ -1.41
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP10-10P60014 251 aa6.2□□□□□ -1.42
C1orf109-211ENST00000494120 MT1FP04733 61 aa6.19□□□□□ -1.42
C1orf109-211ENST00000494120 MT2AP02795 61 aa6.18□□□□□ -1.42
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.12□□□□□ -1.43
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.07□□□□□ -1.44
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.07□□□□□ -1.44
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP10-5P60370 271 aa6.03□□□□□ -1.44
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C1orf109-211ENST00000494120 MT1XP80297 61 aa6.01□□□□□ -1.45
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP12-3P60328 96 aa5.93□□□□□ -1.46
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP10-12P60413 245 aa5.93□□□□□ -1.46
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C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.85□□□□□ -1.47
C1orf109-211ENST00000494120 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.8□□□□□ -1.48
C1orf109-211ENST00000494120 USH2AO75445 5202 aa5.73□□□□□ -1.49
C1orf109-211ENST00000494120 INE1O15225 51 aa5.7□□□□□ -1.5
C1orf109-211ENST00000494120 KMT2DO14686 5537 aa5.69□□□□□ -1.5
C1orf109-211ENST00000494120 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.66□□□□□ -1.5
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.66□□□□□ -1.5
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C1orf109-211ENST00000494120 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.59□□□□□ -1.51
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.51□□□□□ -1.53
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.51□□□□□ -1.53
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.44□□□□□ -1.54
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.36□□□□□ -1.55
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.34□□□□□ -1.55
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.29□□□□□ -1.56
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.28□□□□□ -1.56
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.26□□□□□ -1.57
C1orf109-211ENST00000494120 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.26□□□□□ -1.57
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