RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 PRO0461Q9UI25 63 aa3.73□□□□□ -1.81
CTPS1-209ENST00000480420 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.72□□□□□ -1.81
CTPS1-209ENST00000480420 CSAG1Q6PB30 78 aa3.72□□□□□ -1.81
CTPS1-209ENST00000480420 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.72□□□□□ -1.81
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.7□□□□□ -1.82
CTPS1-209ENST00000480420 ETDBQ3ZM63 59 aa3.7□□□□□ -1.82
CTPS1-209ENST00000480420 LCA10Q71F78 164 aa3.7□□□□□ -1.82
CTPS1-209ENST00000480420 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.7□□□□□ -1.82
CTPS1-209ENST00000480420 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.68□□□□□ -1.82
CTPS1-209ENST00000480420 F8W1H4 67 aa3.67□□□□□ -1.82
CTPS1-209ENST00000480420 A6NN06 94 aa3.66□□□□□ -1.82
CTPS1-209ENST00000480420 Q5VV11 94 aa3.66□□□□□ -1.82
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 IMUPQ9GZP8 106 aa3.64□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.64□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.63□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 A0A087WVE0 104 aa3.62□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.61□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 KLKP1Q107X0 134 aa3.61□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 H0Y9P7 68 aa3.6□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 MT1BP07438 61 aa3.6□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFC1O43677 76 aa3.59□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.59□□□□□ -1.83
CTPS1-209ENST00000480420 ACYP1P07311 99 aa3.58□□□□□ -1.84
CTPS1-209ENST00000480420 UQCRQO14949 82 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-209ENST00000480420 ATOX1O00244 68 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00208Q96KT6 92 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP10-5P60370 271 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-209ENST00000480420 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.53□□□□□ -1.84
CTPS1-209ENST00000480420 CRIPTQ9P021 101 aa3.53□□□□□ -1.84
CTPS1-209ENST00000480420 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 KMT2DO14686 5537 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP5-9P26371 169 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 MP68P56378 58 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00643Q86TS7 51 aa3.5□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 A8MUN3 132 aa3.49□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.49□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.49□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 MDN1Q9NU22 5596 aa3.48□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 PCP4P48539 62 aa3.48□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.47□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 PLAC4Q8WY50 150 aa3.47□□□□□ -1.85
CTPS1-209ENST00000480420 SCGB1A1P11684 91 aa3.46□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GV90 55 aa3.45□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 H0YAA0 97 aa3.45□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.45□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 LINC01554Q52M75 96 aa3.45□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 R4GN34 69 aa3.45□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 OCR1Q9BZK8 76 aa3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 M0QZ58 72 aa3.43□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 C20orf197Q8N268 126 aa3.42□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 J3QR89 54 aa3.41□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 P0C880 135 aa3.41□□□□□ -1.86
CTPS1-209ENST00000480420 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.4□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 H3BPC8 53 aa3.38□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 SPRR2EP22531 72 aa3.37□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 SPRR2BP35325 72 aa3.37□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 SPRR2AP35326 72 aa3.37□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 MT1XP80297 61 aa3.37□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.37□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 DMAC1Q96GE9 116 aa3.37□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.36□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.36□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 MT-ATP8P03928 68 aa3.35□□□□□ -1.87
CTPS1-209ENST00000480420 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.33□□□□□ -1.88
CTPS1-209ENST00000480420 ACYP2P14621 99 aa3.33□□□□□ -1.88
CTPS1-209ENST00000480420 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.32□□□□□ -1.88
CTPS1-209ENST00000480420 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.32□□□□□ -1.88
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-209ENST00000480420 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.28□□□□□ -1.88
CTPS1-209ENST00000480420 SNURFQ9Y675 71 aa3.27□□□□□ -1.89
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP12-2P59991 146 aa3.26□□□□□ -1.89
CTPS1-209ENST00000480420 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.26□□□□□ -1.89
CTPS1-209ENST00000480420 SPRR2DP22532 72 aa3.25□□□□□ -1.89
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CTPS1-209ENST00000480420 K7ERU9 68 aa3.23□□□□□ -1.89
CTPS1-209ENST00000480420 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.21□□□□□ -1.9
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP10-12P60413 245 aa3.18□□□□□ -1.9
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0D9SG42 100 aa3.16□□□□□ -1.9
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.15□□□□□ -1.91
CTPS1-209ENST00000480420 SEC61GP60059 68 aa3.14□□□□□ -1.91
CTPS1-209ENST00000480420 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.14□□□□□ -1.91
CTPS1-209ENST00000480420 SERP2Q8N6R1 65 aa3.13□□□□□ -1.91
CTPS1-209ENST00000480420 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.13□□□□□ -1.91
CTPS1-209ENST00000480420 COA5Q86WW8 74 aa3.12□□□□□ -1.91
CTPS1-209ENST00000480420 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CTPS1-209ENST00000480420 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.11□□□□□ -1.91
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.09□□□□□ -1.91
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GU33 70 aa3.05□□□□□ -1.92
CTPS1-209ENST00000480420 COX7CP15954 63 aa3.02□□□□□ -1.93
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3□□□□□ -1.93
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GU69 56 aa2.99□□□□□ -1.93
CTPS1-209ENST00000480420 MT1EP04732 61 aa2.99□□□□□ -1.93
CTPS1-209ENST00000480420 V9GYY9 64 aa2.99□□□□□ -1.93
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP12-1P59990 96 aa2.98□□□□□ -1.93
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.98□□□□□ -1.93
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