RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		7.97	□□□□□ -1.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		7.96	□□□□□ -1.14
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087WVE0	104 aa		7.93	□□□□□ -1.14
MRPL28-203	ENST00000429738		Q5VV11	94 aa		7.93	□□□□□ -1.14
MRPL28-203	ENST00000429738	KLKP1	Q107X0	134 aa		7.92	□□□□□ -1.14
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		7.91	□□□□□ -1.14
MRPL28-203	ENST00000429738		K7ERU9	68 aa		7.91	□□□□□ -1.14
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP5-9	P26371	169 aa		7.89	□□□□□ -1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		7.88	□□□□□ -1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	KMT2D	O14686	5537 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP10-5	P60370	271 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MDN1	Q9NU22	5596 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	MT-ATP8	P03928	68 aa		7.81	□□□□□ -1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	UQCRQ	O14949	82 aa		7.79	□□□□□ -1.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CRIPT	Q9P021	101 aa		7.79	□□□□□ -1.16
MRPL28-203	ENST00000429738		H0Y9P7	68 aa		7.76	□□□□□ -1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	ATOX1	O00244	68 aa		7.76	□□□□□ -1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		7.75	□□□□□ -1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		7.75	□□□□□ -1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	IMUP	Q9GZP8	106 aa		7.75	□□□□□ -1.17
MRPL28-203	ENST00000429738		H0YAA0	97 aa		7.73	□□□□□ -1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	OCR1	Q9BZK8	76 aa		7.73	□□□□□ -1.17
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFC1	O43677	76 aa		7.7	□□□□□ -1.18
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MUN3	132 aa		7.68	□□□□□ -1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SCGB1A1	P11684	91 aa		7.66	□□□□□ -1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00208	Q96KT6	92 aa		7.62	□□□□□ -1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	MP68	P56378	58 aa		7.6	□□□□□ -1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		7.59	□□□□□ -1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRR2E	P22531	72 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRR2B	P35325	72 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRR2A	P35326	72 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BPC8	53 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		7.47	□□□□□ -1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	MT1X	P80297	61 aa		7.46	□□□□□ -1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		7.44	□□□□□ -1.22
MRPL28-203	ENST00000429738		P0C880	135 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	DMAC1	Q96GE9	116 aa		7.43	□□□□□ -1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	SERP2	Q8N6R1	65 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PLAC4	Q8WY50	150 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MRPL28-203	ENST00000429738		R4GN34	69 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	C20orf197	Q8N268	126 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	SNURF	Q9Y675	71 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		7.35	□□□□□ -1.23
MRPL28-203	ENST00000429738		M0QZ58	72 aa		7.34	□□□□□ -1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP12-2	P59991	146 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRR2D	P22532	72 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	COX7C	P15954	63 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01554	Q52M75	96 aa		7.21	□□□□□ -1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	ACYP2	P14621	99 aa		7.2	□□□□□ -1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		7.2	□□□□□ -1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		7.18	□□□□□ -1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		7.18	□□□□□ -1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		7.17	□□□□□ -1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		7.17	□□□□□ -1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	LCE3B	Q5TA77	95 aa		7.14	□□□□□ -1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		7.12	□□□□□ -1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		7.11	□□□□□ -1.27
MRPL28-203	ENST00000429738		H7BZZ5	65 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP10-12	P60413	245 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MRPL28-203	ENST00000429738	COA5	Q86WW8	74 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MRPL28-203	ENST00000429738	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		6.91	□□□□□ -1.3
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	6.81	□□□□□ -1.32
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM258	P61165	79 aa		6.78	□□□□□ -1.32
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC61G	P60059	68 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MRPL28-203	ENST00000429738	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MRPL28-203	ENST00000429738	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0D9SG42	100 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MRPL28-203	ENST00000429738	MT1E	P04732	61 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GU69	56 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRPL28-203	ENST00000429738	PCP4	P48539	62 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GU33	70 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP12-1	P59990	96 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR15L	Q9BU68	103 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.45	□□□□□ -1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.43	□□□□□ -1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	MT1G	P13640	62 aa		6.41	□□□□□ -1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	MT4	P47944	62 aa		6.41	□□□□□ -1.38
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		6.38	□□□□□ -1.39
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MU10	97 aa		6.38	□□□□□ -1.39
MRPL28-203	ENST00000429738		Q1T7F1	81 aa		6.33	□□□□□ -1.4

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