RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.68□□□□□ -0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.67□□□□□ -0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 K7ERS5 55 aa9.67□□□□□ -0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.67□□□□□ -0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CRIPTQ9P021 101 aa9.65□□□□□ -0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 Q5VSD8 79 aa9.64□□□□□ -0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.59□□□□□ -0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 MYCBP2O75592 4640 aa9.56□□□□□ -0.88
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP10-8P60410 259 aa9.5□□□□□ -0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RALGPS1-208ENST00000424082 P0C880 135 aa9.45□□□□□ -0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.44□□□□□ -0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.43□□□□□ -0.9
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0D9SG42 100 aa9.39□□□□□ -0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.38□□□□□ -0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 TPRXLQ17RH7 258 aa9.37□□□□□ -0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 MT1HL1P0DM35 61 aa9.34□□□□□ -0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.29□□□□□ -0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.28□□□□□ -0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 S4R3F8 94 aa9.27□□□□□ -0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 XP32Q5T750 250 aa9.26□□□□□ -0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.25□□□□□ -0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.18□□□□□ -0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP12-2P59991 146 aa9.16□□□□□ -0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa9.12□□□□□ -0.95
RALGPS1-208ENST00000424082 LPAP08519 4548 aa9.12□□□□□ -0.95
RALGPS1-208ENST00000424082 LRP2P98164 4655 aa9.08□□□□□ -0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 HERC2O95714 4834 aa9.07□□□□□ -0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP12-1P59990 96 aa9.07□□□□□ -0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.02□□□□□ -0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFAF8A1L188 74 aa9.01□□□□□ -0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 M0QZ58 72 aa8.9□□□□□ -0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 J3QL48 77 aa8.86□□□□□ -0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.72□□□□□ -1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 HERC1Q15751 4861 aa8.7□□□□□ -1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MUC17Q685J3 4493 aa8.68□□□□□ -1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 R4GN34 69 aa8.63□□□□□ -1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.61□□□□□ -1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RALGPS1-208ENST00000424082 MUC2Q02817 5179 aa8.55□□□□□ -1.04
RALGPS1-208ENST00000424082 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RALGPS1-208ENST00000424082 PLAC4Q8WY50 150 aa8.54□□□□□ -1.04
RALGPS1-208ENST00000424082 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.53□□□□□ -1.04
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.36□□□□□ -1.07
RALGPS1-208ENST00000424082 PP632Q6XCG6 107 aa8.29□□□□□ -1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0A0MQY5 61 aa8.28□□□□□ -1.08
RALGPS1-208ENST00000424082 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.22□□□□□ -1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 LUZP6Q538Z0 58 aa8.2□□□□□ -1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.2□□□□□ -1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.17□□□□□ -1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF213Q63HN8 5207 aa8.15□□□□□ -1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 LCE2CQ5TA81 110 aa8.04□□□□□ -1.12
RALGPS1-208ENST00000424082 TNP1P09430 55 aa7.96□□□□□ -1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.93□□□□□ -1.14
RALGPS1-208ENST00000424082 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.9□□□□□ -1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 MT1HP80294 61 aa7.84□□□□□ -1.15
RALGPS1-208ENST00000424082 M0R2T5 61 aa7.79□□□□□ -1.16
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.66□□□□□ -1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.66□□□□□ -1.18
RALGPS1-208ENST00000424082 MT2AP02795 61 aa7.61□□□□□ -1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 MT1FP04733 61 aa7.61□□□□□ -1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.61□□□□□ -1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP10-10P60014 251 aa7.56□□□□□ -1.2
RALGPS1-208ENST00000424082 LCE3AQ5TA76 89 aa7.52□□□□□ -1.21
RALGPS1-208ENST00000424082 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.31□□□□□ -1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.3□□□□□ -1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.27□□□□□ -1.24
RALGPS1-208ENST00000424082 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 MT1BP07438 61 aa7.25□□□□□ -1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP10-5P60370 271 aa7.24□□□□□ -1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 INE1O15225 51 aa7.23□□□□□ -1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 MT1XP80297 61 aa7.22□□□□□ -1.25
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP12-3P60328 96 aa7.13□□□□□ -1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP10-12P60413 245 aa7.13□□□□□ -1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 USH2AO75445 5202 aa7.1□□□□□ -1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 LCE2BO14633 110 aa7.1□□□□□ -1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 KMT2DO14686 5537 aa6.82□□□□□ -1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.79□□□□□ -1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.74□□□□□ -1.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SSPOA2VEC9 5147 aa6.71□□□□□ -1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.7□□□□□ -1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.62□□□□□ -1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.55□□□□□ -1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.49□□□□□ -1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.47□□□□□ -1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.44□□□□□ -1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.44□□□□□ -1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.44□□□□□ -1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.44□□□□□ -1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.44□□□□□ -1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms