RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422596.1

TRDN-203, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 3

Gene TRDN, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-203ENST00000422596 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.11□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.11□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.11□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 A8MUU9 505 aa2.1□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.1□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 Q6ZQT0 140 aa2.1□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.1□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 LRP2P98164 4655 aa2.09□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.09□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 A0A1W2PNM2 257 aa2.09□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.09□□□□□ -2.07
TRDN-203ENST00000422596 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.08□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 hDV103S1A0JD37 113 aa2.08□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.08□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 H3BQ85 93 aa2.08□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.08□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 LPAP08519 4548 aa2.08□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 F8WEM9 126 aa2.07□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.07□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.06□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 H3BPC8 53 aa2.06□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 CCKP06307 115 aa2.06□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 MT1HL1P0DM35 61 aa2.06□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 Q6JHZ5 121 aa2.06□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 LINC00846Q9NV44 126 aa2.06□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 A0A087WSZ3 146 aa2.05□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.05□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 ROMO1P60602 79 aa2.05□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 Q96NJ1 140 aa2.05□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 ATOX1O00244 68 aa2.04□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 PDE6GP18545 87 aa2.04□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 RNF213Q63HN8 5207 aa2.04□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.03□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 CASC2Q6XLA1 102 aa2.03□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.03□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.03□□□□□ -2.08
TRDN-203ENST00000422596 ACYP1P07311 99 aa2.02□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.02□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.01□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 K7EQZ3 153 aa2.01□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 IGKV4-1P06312 121 aa2.01□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa2.01□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 LINC00643Q86TS7 51 aa2.01□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.01□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 UBL5Q9BZL1 73 aa2.01□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 A0A087WVE0 104 aa2□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 Q1T7F1 81 aa2□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 SERP2Q8N6R1 65 aa2□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 TMEM254Q8TBM7 123 aa2□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 LIMD2Q9BT23 127 aa2□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa1.99□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 A0A1B0GU33 70 aa1.99□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 SPINK1P00995 79 aa1.99□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 NREPQ16612 68 aa1.99□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 SPAG11AQ6PDA7 123 aa1.98□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 CYSTM1Q9H1C7 97 aa1.98□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 FAT4Q6V0I7 4981 aa1.98□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 MIR22HGQ0VDD5 57 aa1.97□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa1.97□□□□□ -2.09
TRDN-203ENST00000422596 HCG22E2RYF7 251 aa1.96□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 NDUFC1O43677 76 aa1.96□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 SPINT4Q6UDR6 99 aa1.96□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.95□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 P0C880 135 aa1.95□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 WFDC13Q8IUB5 93 aa1.95□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa1.95□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 MUC2Q02817 5179 aa1.95□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa1.94□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 C9orf92A6NGG3 77 aa1.93□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 H7BZZ5 65 aa1.92□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 NDUFB1O75438 58 aa1.92□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 TPRXLQ17RH7 258 aa1.92□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 R4GN34 69 aa1.91□□□□□ -2.1
TRDN-203ENST00000422596 TRAV22A0A0B4J277 110 aa1.9□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa1.9□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 RPL37P61927 97 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 KLKP1Q107X0 134 aa1.9□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 CSAG1Q6PB30 78 aa1.9□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 Q5VV11 94 aa1.89□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 H0Y9P7 68 aa1.87□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 C20orf197Q8N268 126 aa1.87□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.87□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 HRES1P13985 223 aa1.86□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 DMAC1Q96GE9 116 aa1.86□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa1.86□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 PRO2289Q9P1D8 64 aa1.86□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 SNURFQ9Y675 71 aa1.86□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 PCOTHQ58A44 107 aa1.85□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa1.84□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 LINC00208Q96KT6 92 aa1.84□□□□□ -2.11
TRDN-203ENST00000422596 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa1.83□□□□□ -2.12
TRDN-203ENST00000422596 SPINK7P58062 85 aa1.82□□□□□ -2.12
TRDN-203ENST00000422596 PRR15LQ9BU68 103 aa1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms