RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
GDE1-201ENST00000353258 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.86□□□□□ -0.99
GDE1-201ENST00000353258 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
GDE1-201ENST00000353258 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
GDE1-201ENST00000353258 A0A0D9SG42 100 aa8.8□□□□□ -1
GDE1-201ENST00000353258 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.79□□□□□ -1
GDE1-201ENST00000353258 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.78□□□□□ -1
GDE1-201ENST00000353258 NDUFAF8A1L188 74 aa8.77□□□□□ -1.01
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.71□□□□□ -1.01
GDE1-201ENST00000353258 HSPG2P98160 4391 aa8.67□□□□□ -1.02
GDE1-201ENST00000353258 RYR3Q15413 4870 aa8.65□□□□□ -1.03
GDE1-201ENST00000353258 TNXBP22105 4242 aa8.64□□□□□ -1.03
GDE1-201ENST00000353258 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.64□□□□□ -1.03
GDE1-201ENST00000353258 Q5VSD8 79 aa8.63□□□□□ -1.03
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.63□□□□□ -1.03
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.63□□□□□ -1.03
GDE1-201ENST00000353258 MYCBP2O75592 4640 aa8.59□□□□□ -1.04
GDE1-201ENST00000353258 S4R3F8 94 aa8.57□□□□□ -1.04
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.56□□□□□ -1.04
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP10-8P60410 259 aa8.55□□□□□ -1.04
GDE1-201ENST00000353258 RYR1P21817 5038 aa8.54□□□□□ -1.04
GDE1-201ENST00000353258 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.53□□□□□ -1.04
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP12-2P59991 146 aa8.53□□□□□ -1.04
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP12-1P59990 96 aa8.41□□□□□ -1.06
GDE1-201ENST00000353258 XP32Q5T750 250 aa8.4□□□□□ -1.06
GDE1-201ENST00000353258 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
GDE1-201ENST00000353258 MT1HL1P0DM35 61 aa8.35□□□□□ -1.07
GDE1-201ENST00000353258 LPAP08519 4548 aa8.28□□□□□ -1.08
GDE1-201ENST00000353258 LRP2P98164 4655 aa8.25□□□□□ -1.09
GDE1-201ENST00000353258 A0A0A0MQY5 61 aa8.22□□□□□ -1.09
GDE1-201ENST00000353258 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.18□□□□□ -1.1
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.17□□□□□ -1.1
GDE1-201ENST00000353258 M0QZ58 72 aa8.16□□□□□ -1.1
GDE1-201ENST00000353258 LUZP6Q538Z0 58 aa8.08□□□□□ -1.12
GDE1-201ENST00000353258 PLAC4Q8WY50 150 aa8.08□□□□□ -1.12
GDE1-201ENST00000353258 R4GN34 69 aa7.91□□□□□ -1.14
GDE1-201ENST00000353258 HERC2O95714 4834 aa7.88□□□□□ -1.15
GDE1-201ENST00000353258 J3QL48 77 aa7.86□□□□□ -1.15
GDE1-201ENST00000353258 MUC17Q685J3 4493 aa7.81□□□□□ -1.16
GDE1-201ENST00000353258 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.79□□□□□ -1.16
GDE1-201ENST00000353258 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
GDE1-201ENST00000353258 PP632Q6XCG6 107 aa7.69□□□□□ -1.18
GDE1-201ENST00000353258 MUC2Q02817 5179 aa7.68□□□□□ -1.18
GDE1-201ENST00000353258 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.62□□□□□ -1.19
GDE1-201ENST00000353258 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.59□□□□□ -1.19
GDE1-201ENST00000353258 HERC1Q15751 4861 aa7.56□□□□□ -1.2
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.55□□□□□ -1.2
GDE1-201ENST00000353258 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.51□□□□□ -1.21
GDE1-201ENST00000353258 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
GDE1-201ENST00000353258 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.4□□□□□ -1.23
GDE1-201ENST00000353258 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.39□□□□□ -1.23
GDE1-201ENST00000353258 TNP1P09430 55 aa7.33□□□□□ -1.24
GDE1-201ENST00000353258 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.25□□□□□ -1.25
GDE1-201ENST00000353258 RNF213Q63HN8 5207 aa7.21□□□□□ -1.26
GDE1-201ENST00000353258 LCE2CQ5TA81 110 aa7.17□□□□□ -1.26
GDE1-201ENST00000353258 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.15□□□□□ -1.26
GDE1-201ENST00000353258 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.11□□□□□ -1.27
GDE1-201ENST00000353258 M0R2T5 61 aa7.1□□□□□ -1.27
GDE1-201ENST00000353258 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GDE1-201ENST00000353258 MT1HP80294 61 aa7□□□□□ -1.29
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.93□□□□□ -1.3
GDE1-201ENST00000353258 LCE3AQ5TA76 89 aa6.92□□□□□ -1.3
GDE1-201ENST00000353258 INE1O15225 51 aa6.91□□□□□ -1.3
GDE1-201ENST00000353258 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.9□□□□□ -1.3
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP10-10P60014 251 aa6.89□□□□□ -1.31
GDE1-201ENST00000353258 MT1FP04733 61 aa6.88□□□□□ -1.31
GDE1-201ENST00000353258 MT2AP02795 61 aa6.86□□□□□ -1.31
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.81□□□□□ -1.32
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.69□□□□□ -1.34
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.6□□□□□ -1.35
GDE1-201ENST00000353258 MT1BP07438 61 aa6.6□□□□□ -1.35
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP12-3P60328 96 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP10-5P60370 271 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-201ENST00000353258 MT1XP80297 61 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP10-12P60413 245 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-201ENST00000353258 USH2AO75445 5202 aa6.39□□□□□ -1.39
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
GDE1-201ENST00000353258 LCE2BO14633 110 aa6.33□□□□□ -1.4
GDE1-201ENST00000353258 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GDE1-201ENST00000353258 KMT2DO14686 5537 aa6.23□□□□□ -1.41
GDE1-201ENST00000353258 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.17□□□□□ -1.42
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.11□□□□□ -1.43
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.06□□□□□ -1.44
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.06□□□□□ -1.44
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.06□□□□□ -1.44
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.97□□□□□ -1.45
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.97□□□□□ -1.45
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.97□□□□□ -1.45
GDE1-201ENST00000353258 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.94□□□□□ -1.46
GDE1-201ENST00000353258 SSPOA2VEC9 5147 aa5.87□□□□□ -1.47
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.83□□□□□ -1.48
GDE1-201ENST00000353258 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.81□□□□□ -1.48
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.81□□□□□ -1.48
GDE1-201ENST00000353258 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.81□□□□□ -1.48
GDE1-201ENST00000353258 MT1EP04732 61 aa5.64□□□□□ -1.51
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