RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.14□□□□□ -1.11
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.14□□□□□ -1.11
HOXA3-201ENST00000317201 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.13□□□□□ -1.11
HOXA3-201ENST00000317201 IGKV2-30P06310 120 aa8.13□□□□□ -1.11
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP10-8P60410 259 aa8.12□□□□□ -1.11
HOXA3-201ENST00000317201 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.09□□□□□ -1.11
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXA3-201ENST00000317201 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HOXA3-201ENST00000317201 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HOXA3-201ENST00000317201 TNXBP22105 4242 aa8.04□□□□□ -1.12
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXA3-201ENST00000317201 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1B0GU33 70 aa8.01□□□□□ -1.13
HOXA3-201ENST00000317201 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.01□□□□□ -1.13
HOXA3-201ENST00000317201 TPRXLQ17RH7 258 aa8□□□□□ -1.13
HOXA3-201ENST00000317201 LUZP6Q538Z0 58 aa7.97□□□□□ -1.13
HOXA3-201ENST00000317201 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
HOXA3-201ENST00000317201 MT1HL1P0DM35 61 aa7.95□□□□□ -1.14
HOXA3-201ENST00000317201 K7ERS5 55 aa7.93□□□□□ -1.14
HOXA3-201ENST00000317201 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.9□□□□□ -1.14
HOXA3-201ENST00000317201 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.84□□□□□ -1.15
HOXA3-201ENST00000317201 C9orf92A6NGG3 77 aa7.83□□□□□ -1.16
HOXA3-201ENST00000317201 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.83□□□□□ -1.16
HOXA3-201ENST00000317201 MYCBP2O75592 4640 aa7.83□□□□□ -1.16
HOXA3-201ENST00000317201 HERC2O95714 4834 aa7.77□□□□□ -1.17
HOXA3-201ENST00000317201 A0A0D9SG42 100 aa7.76□□□□□ -1.17
HOXA3-201ENST00000317201 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.74□□□□□ -1.17
HOXA3-201ENST00000317201 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.69□□□□□ -1.18
HOXA3-201ENST00000317201 XP32Q5T750 250 aa7.69□□□□□ -1.18
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.57□□□□□ -1.2
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.56□□□□□ -1.2
HOXA3-201ENST00000317201 S4R3F8 94 aa7.4□□□□□ -1.22
HOXA3-201ENST00000317201 LRP2P98164 4655 aa7.38□□□□□ -1.23
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP12-2P59991 146 aa7.38□□□□□ -1.23
HOXA3-201ENST00000317201 LPAP08519 4548 aa7.38□□□□□ -1.23
HOXA3-201ENST00000317201 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.38□□□□□ -1.23
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HOXA3-201ENST00000317201 MUC17Q685J3 4493 aa7.31□□□□□ -1.24
HOXA3-201ENST00000317201 PLAC4Q8WY50 150 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXA3-201ENST00000317201 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXA3-201ENST00000317201 HERC1Q15751 4861 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXA3-201ENST00000317201 LCE2CQ5TA81 110 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXA3-201ENST00000317201 LCE2BO14633 110 aa7.19□□□□□ -1.26
HOXA3-201ENST00000317201 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.19□□□□□ -1.26
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP12-1P59990 96 aa7.18□□□□□ -1.26
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.17□□□□□ -1.26
HOXA3-201ENST00000317201 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXA3-201ENST00000317201 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HOXA3-201ENST00000317201 MUC2Q02817 5179 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXA3-201ENST00000317201 RNF213Q63HN8 5207 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXA3-201ENST00000317201 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXA3-201ENST00000317201 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXA3-201ENST00000317201 M0QZ58 72 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXA3-201ENST00000317201 MT1HP80294 61 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXA3-201ENST00000317201 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HOXA3-201ENST00000317201 R4GN34 69 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXA3-201ENST00000317201 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXA3-201ENST00000317201 M0R2T5 61 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXA3-201ENST00000317201 PP632Q6XCG6 107 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXA3-201ENST00000317201 INE1O15225 51 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXA3-201ENST00000317201 MT2AP02795 61 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXA3-201ENST00000317201 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXA3-201ENST00000317201 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.41□□□□□ -1.38
HOXA3-201ENST00000317201 MT1FP04733 61 aa6.4□□□□□ -1.39
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP10-10P60014 251 aa6.37□□□□□ -1.39
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.35□□□□□ -1.39
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXA3-201ENST00000317201 TNP1P09430 55 aa6.14□□□□□ -1.43
HOXA3-201ENST00000317201 MT1BP07438 61 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXA3-201ENST00000317201 MT1XP80297 61 aa5.93□□□□□ -1.46
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP10-5P60370 271 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXA3-201ENST00000317201 LCE3AQ5TA76 89 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXA3-201ENST00000317201 USH2AO75445 5202 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP10-12P60413 245 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXA3-201ENST00000317201 SSPOA2VEC9 5147 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.6□□□□□ -1.51
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.5□□□□□ -1.53
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP12-3P60328 96 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXA3-201ENST00000317201 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.37□□□□□ -1.55
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.36□□□□□ -1.55
HOXA3-201ENST00000317201 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXA3-201ENST00000317201 KMT2DO14686 5537 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXA3-201ENST00000317201 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXA3-201ENST00000317201 MT1EP04732 61 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.18□□□□□ -1.58
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXA3-201ENST00000317201 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.11□□□□□ -1.59
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