RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPRR4Q96PI1 79 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A0A0A0MQY5 61 aa4.47□□□□□ -1.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.47□□□□□ -1.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.47□□□□□ -1.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LINC00483Q53H64 154 aa4.46□□□□□ -1.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CSAG1Q6PB30 78 aa4.46□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.44□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.44□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.44□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP5-9P26371 169 aa4.44□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 Q8N377 158 aa4.44□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LRP2P98164 4655 aa4.43□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ROMO1P60602 79 aa4.42□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.42□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPRR1BP22528 89 aa4.42□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HRES1P13985 223 aa4.41□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.4□□□□□ -1.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LPAP08519 4548 aa4.4□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.39□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.38□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.37□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.37□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPINK1P00995 79 aa4.36□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.36□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A8MWP4 228 aa4.35□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.35□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PCOTHQ58A44 107 aa4.35□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 UQCR11O14957 56 aa4.33□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.33□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A0A1B0GU69 56 aa4.32□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.32□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.31□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A0A0G2JQZ4 141 aa4.31□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.3□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.3□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TPRXLQ17RH7 258 aa4.29□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IGFL1Q6UW32 110 aa4.29□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A0A087WSZ3 146 aa4.28□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ACYP2P14621 99 aa4.28□□□□□ -1.72
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 P0C880 135 aa4.27□□□□□ -1.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RNF213Q63HN8 5207 aa4.27□□□□□ -1.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.26□□□□□ -1.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.25□□□□□ -1.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MUC2Q02817 5179 aa4.24□□□□□ -1.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.23□□□□□ -1.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DMAC1Q96GE9 116 aa4.22□□□□□ -1.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.22□□□□□ -1.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A8MUU9 505 aa4.21□□□□□ -1.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.2□□□□□ -1.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.18□□□□□ -1.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MUC17Q685J3 4493 aa4.18□□□□□ -1.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C9orf92A6NGG3 77 aa4.16□□□□□ -1.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.16□□□□□ -1.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 Q96NJ1 140 aa4.15□□□□□ -1.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A0A1B0GVX0 72 aa4.13□□□□□ -1.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LCE1EQ5T753 118 aa4.13□□□□□ -1.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.11□□□□□ -1.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NDUFAF8A1L188 74 aa4.11□□□□□ -1.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 Q5W150 140 aa4.1□□□□□ -1.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 K7ERS5 55 aa4.08□□□□□ -1.76
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.07□□□□□ -1.76
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LUZP6Q538Z0 58 aa4.07□□□□□ -1.76
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.07□□□□□ -1.76
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.06□□□□□ -1.76
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 H0YAA0 97 aa4.03□□□□□ -1.76
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IGKV2-30P06310 120 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CRIPTQ9P021 101 aa3.94□□□□□ -1.78
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A0A1B0GU33 70 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.93□□□□□ -1.78
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MT1HP80294 61 aa3.92□□□□□ -1.78
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.89□□□□□ -1.79
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.89□□□□□ -1.79
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 M0R2T5 61 aa3.81□□□□□ -1.8
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.77□□□□□ -1.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.76□□□□□ -1.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.72□□□□□ -1.81
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.71□□□□□ -1.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MT2AP02795 61 aa3.67□□□□□ -1.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.65□□□□□ -1.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MT1FP04733 61 aa3.65□□□□□ -1.82
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.64□□□□□ -1.83
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PLAC4Q8WY50 150 aa3.63□□□□□ -1.83
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 S4R3F8 94 aa3.63□□□□□ -1.83
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.63□□□□□ -1.83
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP10-10P60014 251 aa3.62□□□□□ -1.83
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.61□□□□□ -1.83
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.6□□□□□ -1.83
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A0A0D9SG42 100 aa3.59□□□□□ -1.83
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms