RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
TMOD2-201ENST00000249700 RYR3Q15413 4870 aa3.27□□□□□ -1.89
TMOD2-201ENST00000249700 DNAH2Q9P225 4427 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-201ENST00000249700 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-201ENST00000249700 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.26□□□□□ -1.89
TMOD2-201ENST00000249700 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-201ENST00000249700 LYSTQ99698 3801 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD2-201ENST00000249700 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD2-201ENST00000249700 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD2-201ENST00000249700 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD2-201ENST00000249700 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.21□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 XP32Q5T750 250 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 KMT2AQ03164 3969 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.17□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 MYCBP2O75592 4640 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 A6NN06 94 aa3.15□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.15□□□□□ -1.9
TMOD2-201ENST00000249700 MT1HL1P0DM35 61 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD2-201ENST00000249700 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD2-201ENST00000249700 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TMOD2-201ENST00000249700 TPRXLQ17RH7 258 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD2-201ENST00000249700 HERC2O95714 4834 aa3.13□□□□□ -1.91
TMOD2-201ENST00000249700 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.12□□□□□ -1.91
TMOD2-201ENST00000249700 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.11□□□□□ -1.91
TMOD2-201ENST00000249700 INE1O15225 51 aa3.09□□□□□ -1.91
TMOD2-201ENST00000249700 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.09□□□□□ -1.91
TMOD2-201ENST00000249700 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.09□□□□□ -1.92
TMOD2-201ENST00000249700 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD2-201ENST00000249700 RNF213Q63HN8 5207 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD2-201ENST00000249700 H0YAA0 97 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD2-201ENST00000249700 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD2-201ENST00000249700 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD2-201ENST00000249700 PKHD1P08F94 4074 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD2-201ENST00000249700 PKD1P98161 4303 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD2-201ENST00000249700 FAT3Q8TDW7 4589 aa3□□□□□ -1.93
TMOD2-201ENST00000249700 LRP2P98164 4655 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD2-201ENST00000249700 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
TMOD2-201ENST00000249700 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.96□□□□□ -1.94
TMOD2-201ENST00000249700 HERC1Q15751 4861 aa2.94□□□□□ -1.94
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa2.94□□□□□ -1.94
TMOD2-201ENST00000249700 LORP23490 312 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD2-201ENST00000249700 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.92□□□□□ -1.94
TMOD2-201ENST00000249700 HSPG2P98160 4391 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD2-201ENST00000249700 MUC2Q02817 5179 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP12-2P59991 146 aa2.88□□□□□ -1.95
TMOD2-201ENST00000249700 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.84□□□□□ -1.96
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP12-1P59990 96 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD2-201ENST00000249700 LPAP08519 4548 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD2-201ENST00000249700 MT3P25713 68 aa2.76□□□□□ -1.97
TMOD2-201ENST00000249700 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.73□□□□□ -1.97
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.73□□□□□ -1.97
TMOD2-201ENST00000249700 TNXBP22105 4242 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP10-12P60413 245 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD2-201ENST00000249700 MUC17Q685J3 4493 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD2-201ENST00000249700 MT1HP80294 61 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD2-201ENST00000249700 LCE2CQ5TA81 110 aa2.64□□□□□ -1.99
TMOD2-201ENST00000249700 MT2AP02795 61 aa2.61□□□□□ -1.99
TMOD2-201ENST00000249700 MT1FP04733 61 aa2.61□□□□□ -1.99
TMOD2-201ENST00000249700 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.6□□□□□ -1.99
TMOD2-201ENST00000249700 USH2AO75445 5202 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD2-201ENST00000249700 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.59□□□□□ -2
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.56□□□□□ -2
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP10-5P60370 271 aa2.56□□□□□ -2
TMOD2-201ENST00000249700 SPRR2EP22531 72 aa2.54□□□□□ -2
TMOD2-201ENST00000249700 SPRR2BP35325 72 aa2.54□□□□□ -2
TMOD2-201ENST00000249700 SPRR2AP35326 72 aa2.54□□□□□ -2
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
TMOD2-201ENST00000249700 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.5□□□□□ -2.01
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP12-3P60328 96 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD2-201ENST00000249700 LCE3AQ5TA76 89 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD2-201ENST00000249700 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
TMOD2-201ENST00000249700 SPRR2DP22532 72 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD2-201ENST00000249700 SSPOA2VEC9 5147 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD2-201ENST00000249700 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.47□□□□□ -2.01
TMOD2-201ENST00000249700 MT1BP07438 61 aa2.45□□□□□ -2.02
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.42□□□□□ -2.02
TMOD2-201ENST00000249700 MT1XP80297 61 aa2.41□□□□□ -2.02
TMOD2-201ENST00000249700 LCE2BO14633 110 aa2.38□□□□□ -2.03
TMOD2-201ENST00000249700 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD2-201ENST00000249700 KMT2DO14686 5537 aa2.3□□□□□ -2.04
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD2-201ENST00000249700 KRTAP12-4P60329 112 aa2.28□□□□□ -2.04
TMOD2-201ENST00000249700 MT4P47944 62 aa2.26□□□□□ -2.05
TMOD2-201ENST00000249700 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.2 ms