RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.97□□□□□ -1.29
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GVX0 72 aa6.96□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFS5O43920 106 aa6.96□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK2AP2O75956 126 aa6.95□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.94□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf195Q5TG92 126 aa6.94□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.94□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP10-1P60331 282 aa6.94□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.93□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCOTHQ58A44 107 aa6.92□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PKHD1P08F94 4074 aa6.92□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BPC8 53 aa6.9□□□□□ -1.3
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.88□□□□□ -1.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.87□□□□□ -1.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZSA8 131 aa6.87□□□□□ -1.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.87□□□□□ -1.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD164Q04900 197 aa6.86□□□□□ -1.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSPHP1O15172 72 aa6.85□□□□□ -1.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.85□□□□□ -1.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q5W150 140 aa6.84□□□□□ -1.31
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A8MU10 97 aa6.83□□□□□ -1.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q1T7F1 81 aa6.82□□□□□ -1.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.82□□□□□ -1.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.82□□□□□ -1.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.8□□□□□ -1.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COA5Q86WW8 74 aa6.79□□□□□ -1.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.79□□□□□ -1.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A8MUN3 132 aa6.78□□□□□ -1.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.78□□□□□ -1.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00313P59037 77 aa6.77□□□□□ -1.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.76□□□□□ -1.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAT1Q14517 4588 aa6.75□□□□□ -1.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PMAIP1Q13794 54 aa6.73□□□□□ -1.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C8orf87E5RJ46 101 aa6.72□□□□□ -1.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.71□□□□□ -1.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HRES1P13985 223 aa6.71□□□□□ -1.33
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.7□□□□□ -1.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q5VV11 94 aa6.7□□□□□ -1.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.69□□□□□ -1.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRR15LQ9BU68 103 aa6.69□□□□□ -1.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.68□□□□□ -1.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.67□□□□□ -1.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.66□□□□□ -1.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIMD2Q9BT23 127 aa6.66□□□□□ -1.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.66□□□□□ -1.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.65□□□□□ -1.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM229AH3BQW9 127 aa6.65□□□□□ -1.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPINK1P00995 79 aa6.62□□□□□ -1.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.61□□□□□ -1.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV2-30P06310 120 aa6.61□□□□□ -1.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.6□□□□□ -1.35
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACYP2P14621 99 aa6.57□□□□□ -1.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.57□□□□□ -1.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GVY2 172 aa6.56□□□□□ -1.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A6NED7 52 aa6.56□□□□□ -1.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RYR2Q92736 4967 aa6.56□□□□□ -1.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BS24 57 aa6.56□□□□□ -1.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q75L30 129 aa6.56□□□□□ -1.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DMAC1Q96GE9 116 aa6.56□□□□□ -1.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCA10Q71F78 164 aa6.54□□□□□ -1.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf92A6NGG3 77 aa6.52□□□□□ -1.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.51□□□□□ -1.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPINK7P58062 85 aa6.51□□□□□ -1.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.5□□□□□ -1.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.47□□□□□ -1.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8N1X5 172 aa6.46□□□□□ -1.38
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.43□□□□□ -1.38
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.41□□□□□ -1.38
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYCBP2O75592 4640 aa6.4□□□□□ -1.39
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GU69 56 aa6.39□□□□□ -1.39
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RYR3Q15413 4870 aa6.39□□□□□ -1.39
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.39□□□□□ -1.39
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSPG2P98160 4391 aa6.38□□□□□ -1.39
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A8MUU9 505 aa6.37□□□□□ -1.39
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRAC1Q96KF2 57 aa6.37□□□□□ -1.39
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.37□□□□□ -1.39
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNXBP22105 4242 aa6.37□□□□□ -1.39
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.34□□□□□ -1.39
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A6NN06 94 aa6.33□□□□□ -1.4
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.33□□□□□ -1.4
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.31□□□□□ -1.4
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.3□□□□□ -1.4
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q5VSD8 79 aa6.3□□□□□ -1.4
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.29□□□□□ -1.4
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RYR1P21817 5038 aa6.27□□□□□ -1.41
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP10-8P60410 259 aa6.26□□□□□ -1.41
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UQCR11O14957 56 aa6.24□□□□□ -1.41
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.24□□□□□ -1.41
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