RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 LRP2P98164 4655 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATA45Q537H7 98 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 VAMP8Q9BV40 100 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 HIGD1BQ9P298 99 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 LPAP08519 4548 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00575Q6W349 94 aa4.23□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 PRO1933Q9H354 126 aa4.23□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 hADV29S1A0JD25 119 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB37Q96AX2 223 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF213Q63HN8 5207 aa4.21□□□□□ -1.73
EFTUD2-216ENST00000590105 H0YGX0 51 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 SNCGO76070 127 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 TPRXLQ17RH7 258 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 PYY3Q5JQD4 70 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 LCA10Q71F78 164 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 C12orf57Q99622 126 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GU33 70 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 H7C2G1 150 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZQY7 126 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 LIMD2Q9BT23 127 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 A8MU10 97 aa4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 F8WEM9 126 aa4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE1FQ5T754 118 aa4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 Q5XG85 94 aa4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6JHZ5 121 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 MUC17Q685J3 4493 aa4.15□□□□□ -1.74
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0G2JQZ4 141 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GX51 115 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 FXYD2P54710 66 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP10-12P60413 245 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 HSD52Q0P140 79 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 TCL1BO95988 128 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BPC8 53 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 COX6CP09669 75 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01554Q52M75 96 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 J3KT08 172 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 IGFL1Q6UW32 110 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 TAX1BP3O14907 124 aa4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 FABP2P12104 132 aa4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 CLEC2BQ92478 149 aa4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BMG7 143 aa4.09□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP5-9P26371 169 aa4.09□□□□□ -1.75
EFTUD2-216ENST00000590105 C9orf92A6NGG3 77 aa4.08□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BUT2 72 aa4.08□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.08□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 TEN1Q86WV5 123 aa4.08□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR15Q8IV56 129 aa4.08□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 K7ERJ3 54 aa4.07□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAL4O96015 105 aa4.07□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.07□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.07□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 MUC2Q02817 5179 aa4.06□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 M0R143 59 aa4.05□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 TRACP01848 142 aa4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM6P0DI80 62 aa4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 R4GN34 69 aa4.04□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PNM2 257 aa4.03□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.03□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 PCOTHQ58A44 107 aa4.03□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.03□□□□□ -1.76
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.02□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A087WSZ3 146 aa4.02□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.02□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BT86 120 aa4.01□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.99□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 ATXN8Q156A1 80 aa3.99□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.99□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 Q96NJ1 140 aa3.99□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 DSCR8Q96T75 97 aa3.99□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 C9JAW5 83 aa3.98□□□□□ -1.77
EFTUD2-216ENST00000590105 CCKP06307 115 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms