RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.82□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.82□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H7C2G1 150 aa2.81□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPINK1P00995 79 aa2.81□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.81□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.81□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SNHG12Q9BXW3 62 aa2.81□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COX6CP09669 75 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HSD52Q0P140 79 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A0B4J2C4 111 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 F8WEM9 126 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H0YGX0 51 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C1orf195Q5TG92 126 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00575Q6W349 94 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1B0GV90 55 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C9orf92A6NGG3 77 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H3BQ85 93 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNAL4O96015 105 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FXYD2P54710 66 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A0U1RQV1 116 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1B0GX51 115 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PSMB2P49721 201 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q6ZQY7 126 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 hADV29S1A0JD25 119 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BATFQ16520 125 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LCE1CQ5T751 118 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q5XG85 94 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LIMD2Q9BT23 127 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H3BUT2 72 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 K7ERJ3 54 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MT1HP80294 61 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PCOTHQ58A44 107 aa2.75□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CD164Q04900 197 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q6JHZ5 121 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q96NJ1 140 aa2.74□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CLEC2BQ92478 149 aa2.73□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USH2AO75445 5202 aa2.72□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.72□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1W2PNM2 257 aa2.72□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.72□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TAX1BP3O14907 124 aa2.72□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TCL1BO95988 128 aa2.72□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.72□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.72□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.71□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FABP2P12104 132 aa2.71□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SSPOA2VEC9 5147 aa2.71□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRACP01848 142 aa2.7□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATXN8Q156A1 80 aa2.7□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1B0GV72 72 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1W2PPM0 123 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H3BMG7 143 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 K7EP34 96 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BPY2O14599 106 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q6Q795 121 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DSCR8Q96T75 97 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LST1O00453 97 aa2.67□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PDE6GP18545 87 aa2.67□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TEN1Q86WV5 123 aa2.67□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.67□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.67□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A087WSZ3 146 aa2.66□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A1B0GW54 56 aa2.66□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.66□□□□□ -1.98
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A8MUU9 505 aa2.65□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.65□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.64□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C9JAW5 83 aa2.64□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H3BT86 120 aa2.64□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 K7ERU9 68 aa2.64□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.64□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.64□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 F8W1H4 67 aa2.63□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCKP06307 115 aa2.63□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 J3KT08 172 aa2.62□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 VPS25Q9BRG1 176 aa2.62□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NDUFB1O75438 58 aa2.61□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HRES1P13985 223 aa2.61□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.61□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms