RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 Q6ZQT0 140 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-212ENST00000568043 A0A1W2PNM2 257 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-212ENST00000568043 ETDBQ3ZM63 59 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-212ENST00000568043 Q5XG85 94 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-212ENST00000568043 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.74□□□□□ -0.85
INO80E-212ENST00000568043 CCKP06307 115 aa9.74□□□□□ -0.85
INO80E-212ENST00000568043 C1orf195Q5TG92 126 aa9.72□□□□□ -0.85
INO80E-212ENST00000568043 A0A1B0GW54 56 aa9.7□□□□□ -0.86
INO80E-212ENST00000568043 VPS25Q9BRG1 176 aa9.69□□□□□ -0.86
INO80E-212ENST00000568043 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.68□□□□□ -0.86
INO80E-212ENST00000568043 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.66□□□□□ -0.86
INO80E-212ENST00000568043 A0A087WSZ3 146 aa9.65□□□□□ -0.86
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INO80E-212ENST00000568043 USH2AO75445 5202 aa9.58□□□□□ -0.88
INO80E-212ENST00000568043 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.56□□□□□ -0.88
INO80E-212ENST00000568043 ACYP1P07311 99 aa9.53□□□□□ -0.88
INO80E-212ENST00000568043 Q96NJ1 140 aa9.53□□□□□ -0.88
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INO80E-212ENST00000568043 LINC00846Q9NV44 126 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-212ENST00000568043 UBL5Q9BZL1 73 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-212ENST00000568043 Q6ZVQ6 151 aa9.48□□□□□ -0.89
INO80E-212ENST00000568043 J3KT08 172 aa9.47□□□□□ -0.89
INO80E-212ENST00000568043 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
INO80E-212ENST00000568043 IGKV4-1P06312 121 aa9.44□□□□□ -0.9
INO80E-212ENST00000568043 SIGMAR1Q99720 223 aa9.44□□□□□ -0.9
INO80E-212ENST00000568043 Q75L30 129 aa9.43□□□□□ -0.9
INO80E-212ENST00000568043 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.42□□□□□ -0.9
INO80E-212ENST00000568043 K7ERU9 68 aa9.41□□□□□ -0.9
INO80E-212ENST00000568043 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.4□□□□□ -0.9
INO80E-212ENST00000568043 BPY2O14599 106 aa9.39□□□□□ -0.91
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INO80E-212ENST00000568043 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.37□□□□□ -0.91
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INO80E-212ENST00000568043 C8orf87E5RJ46 101 aa9.31□□□□□ -0.92
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INO80E-212ENST00000568043 K7EQZ3 153 aa9.29□□□□□ -0.92
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INO80E-212ENST00000568043 A8MUU9 505 aa9.26□□□□□ -0.93
INO80E-212ENST00000568043 LINC00313P59037 77 aa9.25□□□□□ -0.93
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INO80E-212ENST00000568043 MT1FP04733 61 aa9.24□□□□□ -0.93
INO80E-212ENST00000568043 Q8N9L7 120 aa9.24□□□□□ -0.93
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INO80E-212ENST00000568043 KRTAP10-10P60014 251 aa9.1□□□□□ -0.95
INO80E-212ENST00000568043 A0A087WVE0 104 aa9.07□□□□□ -0.96
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INO80E-212ENST00000568043 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.04□□□□□ -0.96
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INO80E-212ENST00000568043 NDUFS5O43920 106 aa9□□□□□ -0.97
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INO80E-212ENST00000568043 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9□□□□□ -0.97
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INO80E-212ENST00000568043 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.95□□□□□ -0.98
INO80E-212ENST00000568043 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.91□□□□□ -0.98
INO80E-212ENST00000568043 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.91□□□□□ -0.98
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INO80E-212ENST00000568043 SCGB1A1P11684 91 aa8.87□□□□□ -0.99
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INO80E-212ENST00000568043 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.83□□□□□ -1
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INO80E-212ENST00000568043 ATOX1O00244 68 aa8.82□□□□□ -1
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INO80E-212ENST00000568043 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.76□□□□□ -1.01
INO80E-212ENST00000568043 H0Y9P7 68 aa8.76□□□□□ -1.01
INO80E-212ENST00000568043 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.76□□□□□ -1.01
INO80E-212ENST00000568043 IGKV2-30P06310 120 aa8.74□□□□□ -1.01
INO80E-212ENST00000568043 C5orf47Q569G3 176 aa8.74□□□□□ -1.01
INO80E-212ENST00000568043 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.72□□□□□ -1.01
INO80E-212ENST00000568043 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.72□□□□□ -1.01
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