RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566121.1

CMTM3-212, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-212ENST00000566121 C9orf118A6NHY6 69 aa7.63□□□□□ -1.19
CMTM3-212ENST00000566121 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
CMTM3-212ENST00000566121 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.62□□□□□ -1.19
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1B0GW54 56 aa7.61□□□□□ -1.19
CMTM3-212ENST00000566121 HRES1P13985 223 aa7.61□□□□□ -1.19
CMTM3-212ENST00000566121 J3KT08 172 aa7.6□□□□□ -1.19
CMTM3-212ENST00000566121 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.6□□□□□ -1.19
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1B0GVX0 72 aa7.59□□□□□ -1.19
CMTM3-212ENST00000566121 DSCR8Q96T75 97 aa7.59□□□□□ -1.19
CMTM3-212ENST00000566121 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.57□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1W2PPM0 123 aa7.57□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.57□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.57□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.57□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 C9JAW5 83 aa7.55□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 Q6ZQT0 140 aa7.55□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1B0GV90 55 aa7.54□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.54□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.53□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 MT2AP02795 61 aa7.53□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 FAM236CP0DP71 79 aa7.53□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1B0GV72 72 aa7.52□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.52□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 PDE6GP18545 87 aa7.52□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 MTURNQ8N3F0 131 aa7.52□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.51□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 NDUFB1O75438 58 aa7.5□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.49□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 K7EP34 96 aa7.49□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.49□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 VPS25Q9BRG1 176 aa7.49□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 ATXN8Q156A1 80 aa7.47□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.47□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CMTM3-212ENST00000566121 SPINK7P58062 85 aa7.46□□□□□ -1.22
CMTM3-212ENST00000566121 A8MWP4 228 aa7.45□□□□□ -1.22
CMTM3-212ENST00000566121 MT1FP04733 61 aa7.45□□□□□ -1.22
CMTM3-212ENST00000566121 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.42□□□□□ -1.22
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CMTM3-212ENST00000566121 LCE2BO14633 110 aa7.41□□□□□ -1.22
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP10-10P60014 251 aa7.4□□□□□ -1.22
CMTM3-212ENST00000566121 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.39□□□□□ -1.23
CMTM3-212ENST00000566121 F8W1H4 67 aa7.38□□□□□ -1.23
CMTM3-212ENST00000566121 PRR15Q8IV56 129 aa7.38□□□□□ -1.23
CMTM3-212ENST00000566121 Q6ZVQ6 151 aa7.37□□□□□ -1.23
CMTM3-212ENST00000566121 PRO0461Q9UI25 63 aa7.37□□□□□ -1.23
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.35□□□□□ -1.23
CMTM3-212ENST00000566121 H3BT86 120 aa7.35□□□□□ -1.23
CMTM3-212ENST00000566121 NREPQ16612 68 aa7.34□□□□□ -1.23
CMTM3-212ENST00000566121 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.33□□□□□ -1.24
CMTM3-212ENST00000566121 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.33□□□□□ -1.24
CMTM3-212ENST00000566121 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CMTM3-212ENST00000566121 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.32□□□□□ -1.24
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.31□□□□□ -1.24
CMTM3-212ENST00000566121 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CMTM3-212ENST00000566121 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.29□□□□□ -1.24
CMTM3-212ENST00000566121 LINC00846Q9NV44 126 aa7.28□□□□□ -1.24
CMTM3-212ENST00000566121 hDV103S1A0JD37 113 aa7.26□□□□□ -1.25
CMTM3-212ENST00000566121 ETDBQ3ZM63 59 aa7.26□□□□□ -1.25
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM3-212ENST00000566121 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM3-212ENST00000566121 K7EQZ3 153 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM3-212ENST00000566121 BPY2O14599 106 aa7.18□□□□□ -1.26
CMTM3-212ENST00000566121 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM3-212ENST00000566121 J3QR89 54 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM3-212ENST00000566121 NDUFS5O43920 106 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM3-212ENST00000566121 Q5W150 140 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM3-212ENST00000566121 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CMTM3-212ENST00000566121 K7ERU9 68 aa7.12□□□□□ -1.27
CMTM3-212ENST00000566121 CXCL6P80162 114 aa7.1□□□□□ -1.27
CMTM3-212ENST00000566121 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.09□□□□□ -1.27
CMTM3-212ENST00000566121 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.09□□□□□ -1.27
CMTM3-212ENST00000566121 IGKV2-30P06310 120 aa7.09□□□□□ -1.27
CMTM3-212ENST00000566121 CASC2Q6XLA1 102 aa7.09□□□□□ -1.27
CMTM3-212ENST00000566121 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CMTM3-212ENST00000566121 ACYP1P07311 99 aa7.07□□□□□ -1.28
CMTM3-212ENST00000566121 HCG22E2RYF7 251 aa7.05□□□□□ -1.28
CMTM3-212ENST00000566121 Q8N9L7 120 aa7.02□□□□□ -1.29
CMTM3-212ENST00000566121 UBL5Q9BZL1 73 aa7.02□□□□□ -1.29
CMTM3-212ENST00000566121 C4orf26Q17RF5 130 aa7□□□□□ -1.29
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.97□□□□□ -1.29
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.97□□□□□ -1.29
CMTM3-212ENST00000566121 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.97□□□□□ -1.29
CMTM3-212ENST00000566121 CSAG1Q6PB30 78 aa6.93□□□□□ -1.3
CMTM3-212ENST00000566121 LINC00643Q86TS7 51 aa6.93□□□□□ -1.3
CMTM3-212ENST00000566121 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.9□□□□□ -1.3
CMTM3-212ENST00000566121 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.9□□□□□ -1.3
CMTM3-212ENST00000566121 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM3-212ENST00000566121 S4R3F8 94 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM3-212ENST00000566121 C5orf47Q569G3 176 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM3-212ENST00000566121 LCA10Q71F78 164 aa6.85□□□□□ -1.31
CMTM3-212ENST00000566121 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.84□□□□□ -1.31
CMTM3-212ENST00000566121 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.84□□□□□ -1.31
CMTM3-212ENST00000566121 MT-ATP8P03928 68 aa6.83□□□□□ -1.32
CMTM3-212ENST00000566121 MT1BP07438 61 aa6.83□□□□□ -1.32
CMTM3-212ENST00000566121 Q5VV11 94 aa6.82□□□□□ -1.32
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