RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NUMB-231	ENST00000559312		Q5XG85	94 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NUMB-231	ENST00000559312	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	PDE6G	P18545	87 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312		K7ERU9	68 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GV72	72 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1W2PNM2	257 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	CCK	P06307	115 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	PRR4	Q16378	134 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GW54	56 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312		F8W1H4	67 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312		A0A087WSZ3	146 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312		Q6ZQT0	140 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	LRP2	P98164	4655 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312		J3QR89	54 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.15	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.15	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.15	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312		Q96NJ1	140 aa		4.15	□□□□□ -1.74
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUMB-231	ENST00000559312	LPA	P08519	4548 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUMB-231	ENST00000559312		J3KT08	172 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUMB-231	ENST00000559312	NREP	Q16612	68 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUMB-231	ENST00000559312	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NUMB-231	ENST00000559312	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUMB-231	ENST00000559312	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUMB-231	ENST00000559312	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUMB-231	ENST00000559312	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUMB-231	ENST00000559312	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFB1	O75438	58 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312		Q6ZVQ6	151 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312		A8MWP4	228 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	ACYP1	P07311	99 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GVX0	72 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	BPY2	O14599	106 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00313	P59037	77 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	DSCR10	P59022	87 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NUMB-231	ENST00000559312		A8MUU9	505 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312		K7EQZ3	153 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	CXCL6	P80162	114 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	PCOTH	Q58A44	107 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312		Q8N9L7	120 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	MUC2	Q02817	5179 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	hDV103S1	A0JD37	113 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00643	Q86TS7	51 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
NUMB-231	ENST00000559312	HCG22	E2RYF7	251 aa		3.95	□□□□□ -1.78
NUMB-231	ENST00000559312	CASC2	Q6XLA1	102 aa		3.95	□□□□□ -1.78
NUMB-231	ENST00000559312	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		3.95	□□□□□ -1.78
NUMB-231	ENST00000559312	IMUP	Q9GZP8	106 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NUMB-231	ENST00000559312	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NUMB-231	ENST00000559312		A0A0U1RQV1	116 aa		3.92	□□□□□ -1.78
NUMB-231	ENST00000559312	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		3.92	□□□□□ -1.78
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFS5	O43920	106 aa		3.91	□□□□□ -1.78
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78

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