RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRB-209ENST00000550857 Q5W150 140 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRB-209ENST00000550857 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRB-209ENST00000550857 TENM4Q6N022 2769 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRB-209ENST00000550857 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-209ENST00000550857 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRB-209ENST00000550857 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-209ENST00000550857 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRB-209ENST00000550857 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
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