RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533677.1

PAFAH1B2-208, Transcript of platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene PAFAH1B2, Length 756 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CTAG1AP78358 180 aa3.85□□□□□ -1.79
PAFAH1B2-208ENST00000533677 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PAFAH1B2-208ENST00000533677 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.85□□□□□ -1.79
PAFAH1B2-208ENST00000533677 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.83□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 H3BUT2 72 aa3.83□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.83□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 A0A1B0GV72 72 aa3.82□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LCE1CQ5T751 118 aa3.82□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.82□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.82□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SLC25A20O43772 301 aa3.81□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SPINK1P00995 79 aa3.81□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 VAMP3Q15836 100 aa3.81□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.8□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 PSMB2P49721 201 aa3.79□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 BATFQ16520 125 aa3.79□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TPRXLQ17RH7 258 aa3.79□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TSTD3H0UI37 97 aa3.78□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 H0YGX0 51 aa3.78□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LST1O00453 97 aa3.78□□□□□ -1.8
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TCL1BO95988 128 aa3.77□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 C9orf92A6NGG3 77 aa3.76□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 F8WEM9 126 aa3.76□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.76□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 C1orf195Q5TG92 126 aa3.76□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.76□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 A0A1B0GX51 115 aa3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 A0A1W2PNM2 257 aa3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 M0R143 59 aa3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TAX1BP3O14907 124 aa3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 FABP2P12104 132 aa3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CD164Q04900 197 aa3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LIMD2Q9BT23 127 aa3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.75□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.74□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 H3BMG7 143 aa3.73□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 DNAL4O96015 105 aa3.73□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TRACP01848 142 aa3.73□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.73□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 Q5XG85 94 aa3.73□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 Q96NJ1 140 aa3.73□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 A0A087WSZ3 146 aa3.72□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 A0A0U1RQV1 116 aa3.72□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 Q6JHZ5 121 aa3.72□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PAFAH1B2-208ENST00000533677 COX6CP09669 75 aa3.71□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.7□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 BPY2O14599 106 aa3.7□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 Q6Q795 121 aa3.7□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 A0A1W2PPM0 123 aa3.69□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ATXN8Q156A1 80 aa3.69□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.69□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TEN1Q86WV5 123 aa3.69□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.69□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 C9JAW5 83 aa3.68□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.68□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.68□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SNCGO76070 127 aa3.67□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CCKP06307 115 aa3.67□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 VPS25Q9BRG1 176 aa3.67□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.66□□□□□ -1.82
PAFAH1B2-208ENST00000533677 PCOTHQ58A44 107 aa3.65□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 Q6ZQT0 140 aa3.65□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.65□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.64□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SIGMAR1Q99720 223 aa3.64□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.64□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.64□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.63□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.63□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 H3BQ85 93 aa3.62□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 K7EP34 96 aa3.62□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 IGKV4-1P06312 121 aa3.62□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.62□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.62□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 DSCR8Q96T75 97 aa3.62□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.61□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 A8MUU9 505 aa3.61□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 H3BT86 120 aa3.61□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.59□□□□□ -1.83
PAFAH1B2-208ENST00000533677 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.58□□□□□ -1.84
PAFAH1B2-208ENST00000533677 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.58□□□□□ -1.84
PAFAH1B2-208ENST00000533677 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.56□□□□□ -1.84
PAFAH1B2-208ENST00000533677 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.55□□□□□ -1.84
PAFAH1B2-208ENST00000533677 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.55□□□□□ -1.84
PAFAH1B2-208ENST00000533677 K7EQZ3 153 aa3.54□□□□□ -1.84
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LINC00313P59037 77 aa3.54□□□□□ -1.84
PAFAH1B2-208ENST00000533677 MT1HP80294 61 aa3.53□□□□□ -1.84
PAFAH1B2-208ENST00000533677 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.52□□□□□ -1.85
PAFAH1B2-208ENST00000533677 A0A1B0GV90 55 aa3.52□□□□□ -1.85
PAFAH1B2-208ENST00000533677 A8MWP4 228 aa3.52□□□□□ -1.85
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ETDBQ3ZM63 59 aa3.52□□□□□ -1.85
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LINC00846Q9NV44 126 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms