RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532749.1

TMEM25-223, Transcript of transmembrane protein 25, human

TSL 4

Gene TMEM25, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-223	ENST00000532749	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		7.85	□□□□□ -1.15
TMEM25-223	ENST00000532749	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		7.85	□□□□□ -1.15
TMEM25-223	ENST00000532749		A0A087WSZ3	146 aa		7.83	□□□□□ -1.16
TMEM25-223	ENST00000532749	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TMEM25-223	ENST00000532749	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
TMEM25-223	ENST00000532749	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TMEM25-223	ENST00000532749	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		7.82	□□□□□ -1.16
TMEM25-223	ENST00000532749	NREP	Q16612	68 aa		7.8	□□□□□ -1.16
TMEM25-223	ENST00000532749	MT1H	P80294	61 aa		7.79	□□□□□ -1.16
TMEM25-223	ENST00000532749	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		7.79	□□□□□ -1.16
TMEM25-223	ENST00000532749	CD164	Q04900	197 aa		7.78	□□□□□ -1.16
TMEM25-223	ENST00000532749	CXCL6	P80162	114 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TMEM25-223	ENST00000532749	XP32	Q5T750	250 aa		7.77	□□□□□ -1.17
TMEM25-223	ENST00000532749	IMUP	Q9GZP8	106 aa		7.76	□□□□□ -1.17
TMEM25-223	ENST00000532749		Q96NJ1	140 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TMEM25-223	ENST00000532749	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TMEM25-223	ENST00000532749	BPY2	O14599	106 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TMEM25-223	ENST00000532749	DSCR10	P59022	87 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TMEM25-223	ENST00000532749	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
TMEM25-223	ENST00000532749	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TMEM25-223	ENST00000532749		A0A087WVE0	104 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	IGKV4-1	P06312	121 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	SCGB1A1	P11684	91 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749		Q8N9L7	120 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749		Q5XG85	94 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	PCOTH	Q58A44	107 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	LIMD2	Q9BT23	127 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	C9orf92	A6NGG3	77 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749		K7EQZ3	153 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TMEM25-223	ENST00000532749	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
TMEM25-223	ENST00000532749		J3KT08	172 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TMEM25-223	ENST00000532749		A8MWP4	228 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TMEM25-223	ENST00000532749	C1orf195	Q5TG92	126 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TMEM25-223	ENST00000532749	PRR15	Q8IV56	129 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMEM25-223	ENST00000532749		M0R2T5	61 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TMEM25-223	ENST00000532749	USH2A	O75445	5202 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMEM25-223	ENST00000532749		A0A1B0GVX0	72 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMEM25-223	ENST00000532749	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMEM25-223	ENST00000532749	SSPO	A2VEC9	5147 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMEM25-223	ENST00000532749	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TMEM25-223	ENST00000532749	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
TMEM25-223	ENST00000532749	HCG22	E2RYF7	251 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMEM25-223	ENST00000532749	ATOX1	O00244	68 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TMEM25-223	ENST00000532749	NDUFB1	O75438	58 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TMEM25-223	ENST00000532749	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TMEM25-223	ENST00000532749	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMEM25-223	ENST00000532749	PCP4	P48539	62 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMEM25-223	ENST00000532749	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMEM25-223	ENST00000532749	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMEM25-223	ENST00000532749	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMEM25-223	ENST00000532749	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
TMEM25-223	ENST00000532749	CASC2	Q6XLA1	102 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TMEM25-223	ENST00000532749	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TMEM25-223	ENST00000532749	OCR1	Q9BZK8	76 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TMEM25-223	ENST00000532749	C8orf87	E5RJ46	101 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	hDV103S1	A0JD37	113 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	SERP2	Q8N6R1	65 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	COX7C	P15954	63 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	LINC00313	P59037	77 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TMEM25-223	ENST00000532749	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TMEM25-223	ENST00000532749	UQCRQ	O14949	82 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TMEM25-223	ENST00000532749		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TMEM25-223	ENST00000532749	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TMEM25-223	ENST00000532749	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TMEM25-223	ENST00000532749	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TMEM25-223	ENST00000532749	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMEM25-223	ENST00000532749	NDUFS5	O43920	106 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TMEM25-223	ENST00000532749		Q75L30	129 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TMEM25-223	ENST00000532749	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TMEM25-223	ENST00000532749	C20orf197	Q8N268	126 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMEM25-223	ENST00000532749	C5orf47	Q569G3	176 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TMEM25-223	ENST00000532749	KLKP1	Q107X0	134 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749		Q5W150	140 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749		H0Y9P7	68 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749		A8MUU9	505 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749	SNURF	Q9Y675	71 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749	MP68	P56378	58 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TMEM25-223	ENST00000532749		H3BPC8	53 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TMEM25-223	ENST00000532749	LINC00208	Q96KT6	92 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TMEM25-223	ENST00000532749	LCE2B	O14633	110 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TMEM25-223	ENST00000532749	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TMEM25-223	ENST00000532749		H7BZZ5	65 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TMEM25-223	ENST00000532749	MT2A	P02795	61 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TMEM25-223	ENST00000532749	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		7.13	□□□□□ -1.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms