RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529795.1

PACS1-210, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 448 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-210ENST00000529795 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PACS1-210ENST00000529795 A0A1B0GVX0 72 aa6.61□□□□□ -1.35
PACS1-210ENST00000529795 BATFQ16520 125 aa6.61□□□□□ -1.35
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.58□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 C9orf118A6NHY6 69 aa6.56□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.55□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 H3BT86 120 aa6.55□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 NREPQ16612 68 aa6.55□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.55□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.55□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.54□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 A0A1W2PPM0 123 aa6.53□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 A8MWP4 228 aa6.53□□□□□ -1.36
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.51□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 FAM236CP0DP71 79 aa6.51□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 MTURNQ8N3F0 131 aa6.51□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 TAX1BP3O14907 124 aa6.5□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.48□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.47□□□□□ -1.37
PACS1-210ENST00000529795 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.46□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 Q6ZVQ6 151 aa6.46□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 PRR15Q8IV56 129 aa6.46□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.44□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.44□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 BPY2O14599 106 aa6.42□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 HRES1P13985 223 aa6.42□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.42□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.42□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 SPINK7P58062 85 aa6.41□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PACS1-210ENST00000529795 hDV103S1A0JD37 113 aa6.39□□□□□ -1.39
PACS1-210ENST00000529795 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.37□□□□□ -1.39
PACS1-210ENST00000529795 K7EQZ3 153 aa6.36□□□□□ -1.39
PACS1-210ENST00000529795 NDUFS5O43920 106 aa6.36□□□□□ -1.39
PACS1-210ENST00000529795 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.36□□□□□ -1.39
PACS1-210ENST00000529795 UBL5Q9BZL1 73 aa6.35□□□□□ -1.39
PACS1-210ENST00000529795 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.34□□□□□ -1.39
PACS1-210ENST00000529795 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.34□□□□□ -1.39
PACS1-210ENST00000529795 K7EP34 96 aa6.32□□□□□ -1.4
PACS1-210ENST00000529795 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PACS1-210ENST00000529795 CASC2Q6XLA1 102 aa6.3□□□□□ -1.4
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.29□□□□□ -1.4
PACS1-210ENST00000529795 F8W1H4 67 aa6.28□□□□□ -1.4
PACS1-210ENST00000529795 PRO0461Q9UI25 63 aa6.28□□□□□ -1.4
PACS1-210ENST00000529795 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.27□□□□□ -1.41
PACS1-210ENST00000529795 CXCL6P80162 114 aa6.26□□□□□ -1.41
PACS1-210ENST00000529795 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.26□□□□□ -1.41
PACS1-210ENST00000529795 LINC00846Q9NV44 126 aa6.26□□□□□ -1.41
PACS1-210ENST00000529795 HCG22E2RYF7 251 aa6.24□□□□□ -1.41
PACS1-210ENST00000529795 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-210ENST00000529795 IGKV2-30P06310 120 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-210ENST00000529795 Q8N9L7 120 aa6.23□□□□□ -1.41
PACS1-210ENST00000529795 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.22□□□□□ -1.41
PACS1-210ENST00000529795 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.21□□□□□ -1.42
PACS1-210ENST00000529795 MT2AP02795 61 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP10-10P60014 251 aa6.2□□□□□ -1.42
PACS1-210ENST00000529795 ETDBQ3ZM63 59 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-210ENST00000529795 Q5W150 140 aa6.19□□□□□ -1.42
PACS1-210ENST00000529795 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.18□□□□□ -1.42
PACS1-210ENST00000529795 ACYP1P07311 99 aa6.16□□□□□ -1.42
PACS1-210ENST00000529795 MT1FP04733 61 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-210ENST00000529795 C4orf26Q17RF5 130 aa6.09□□□□□ -1.43
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.09□□□□□ -1.43
PACS1-210ENST00000529795 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.07□□□□□ -1.44
PACS1-210ENST00000529795 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.07□□□□□ -1.44
PACS1-210ENST00000529795 USH2AO75445 5202 aa6.03□□□□□ -1.44
PACS1-210ENST00000529795 LCE2BO14633 110 aa6.02□□□□□ -1.45
PACS1-210ENST00000529795 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.02□□□□□ -1.45
PACS1-210ENST00000529795 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6□□□□□ -1.45
PACS1-210ENST00000529795 S4R3F8 94 aa6□□□□□ -1.45
PACS1-210ENST00000529795 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.99□□□□□ -1.45
PACS1-210ENST00000529795 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PACS1-210ENST00000529795 CSAG1Q6PB30 78 aa5.99□□□□□ -1.45
PACS1-210ENST00000529795 ATOX1O00244 68 aa5.97□□□□□ -1.45
PACS1-210ENST00000529795 UQCRQO14949 82 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 C5orf47Q569G3 176 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 LINC00643Q86TS7 51 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.96□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 SSPOA2VEC9 5147 aa5.95□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.93□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 J3QR89 54 aa5.91□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 LCA10Q71F78 164 aa5.9□□□□□ -1.46
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PACS1-210ENST00000529795 H0Y9P7 68 aa5.89□□□□□ -1.47
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.88□□□□□ -1.47
PACS1-210ENST00000529795 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PACS1-210ENST00000529795 A0A1B0GV90 55 aa5.86□□□□□ -1.47
PACS1-210ENST00000529795 MP68P56378 58 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-210ENST00000529795 A8MUN3 132 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-210ENST00000529795 A0A087WVE0 104 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.83□□□□□ -1.48
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