RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526493.1

UBASH3B-204, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 3

Gene UBASH3B, Length 1,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-204ENST00000526493 J3KT08 172 aa7.5□□□□□ -1.21
UBASH3B-204ENST00000526493 K7EQZ3 153 aa7.5□□□□□ -1.21
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UBASH3B-204ENST00000526493 A8MWP4 228 aa7.48□□□□□ -1.21
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UBASH3B-204ENST00000526493 LCE3BQ5TA77 95 aa7.48□□□□□ -1.21
UBASH3B-204ENST00000526493 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.48□□□□□ -1.21
UBASH3B-204ENST00000526493 LIMD2Q9BT23 127 aa7.47□□□□□ -1.21
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UBASH3B-204ENST00000526493 ATOX1O00244 68 aa7.41□□□□□ -1.22
UBASH3B-204ENST00000526493 PCP4P48539 62 aa7.41□□□□□ -1.22
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UBASH3B-204ENST00000526493 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-204ENST00000526493 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.99□□□□□ -1.29
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UBASH3B-204ENST00000526493 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.92□□□□□ -1.3
UBASH3B-204ENST00000526493 LRP2P98164 4655 aa6.92□□□□□ -1.3
UBASH3B-204ENST00000526493 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.91□□□□□ -1.3
UBASH3B-204ENST00000526493 FAM236CP0DP71 79 aa6.91□□□□□ -1.3
UBASH3B-204ENST00000526493 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.9□□□□□ -1.3
UBASH3B-204ENST00000526493 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.89□□□□□ -1.31
UBASH3B-204ENST00000526493 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.88□□□□□ -1.31
UBASH3B-204ENST00000526493 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-204ENST00000526493 HRES1P13985 223 aa6.86□□□□□ -1.31
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