RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC179H3BU77 68 aa6.07□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.06□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.06□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.05□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.05□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.05□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 SPINK1P00995 79 aa6.04□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 IMUPQ9GZP8 106 aa6.04□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 BPY2O14599 106 aa6.03□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP10-8P60410 259 aa6.03□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 Q5XG85 94 aa6.03□□□□□ -1.44
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.02□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 CXCL6P80162 114 aa6.02□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 LIMD2Q9BT23 127 aa6.02□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 J3KT08 172 aa6□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 OXTP01178 125 aa5.99□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.99□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 Q96NJ1 140 aa5.98□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV4-1P06312 121 aa5.97□□□□□ -1.45
TRPS1-210ENST00000519815 DSCR10P59022 87 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 UQCRQO14949 82 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 MT1HL1P0DM35 61 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 C1orf195Q5TG92 126 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 A8MWP4 228 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFB1O75438 58 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 C5orf47Q569G3 176 aa5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 Q8N9L7 120 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 K7EQZ3 153 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 PRR15Q8IV56 129 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 COX7CP15954 63 aa5.91□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 A0A087WVE0 104 aa5.9□□□□□ -1.46
TRPS1-210ENST00000519815 A0A1B0GVX0 72 aa5.89□□□□□ -1.47
TRPS1-210ENST00000519815 ATOX1O00244 68 aa5.89□□□□□ -1.47
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.87□□□□□ -1.47
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM258P61165 79 aa5.86□□□□□ -1.47
TRPS1-210ENST00000519815 HERC2O95714 4834 aa5.86□□□□□ -1.47
TRPS1-210ENST00000519815 HCG22E2RYF7 251 aa5.85□□□□□ -1.47
TRPS1-210ENST00000519815 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.85□□□□□ -1.47
TRPS1-210ENST00000519815 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.85□□□□□ -1.47
TRPS1-210ENST00000519815 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
TRPS1-210ENST00000519815 C8orf87E5RJ46 101 aa5.84□□□□□ -1.47
TRPS1-210ENST00000519815 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.83□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.83□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00313P59037 77 aa5.83□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 CASC2Q6XLA1 102 aa5.83□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 hDV103S1A0JD37 113 aa5.82□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.82□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.82□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 SERP2Q8N6R1 65 aa5.81□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 TNXBP22105 4242 aa5.81□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.79□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 Q75L30 129 aa5.79□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.79□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.79□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 MYCBP2O75592 4640 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPS1-210ENST00000519815 PRR4Q16378 134 aa5.76□□□□□ -1.49
TRPS1-210ENST00000519815 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.76□□□□□ -1.49
TRPS1-210ENST00000519815 C9orf92A6NGG3 77 aa5.75□□□□□ -1.49
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.74□□□□□ -1.49
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFS5O43920 106 aa5.74□□□□□ -1.49
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.73□□□□□ -1.49
TRPS1-210ENST00000519815 OCR1Q9BZK8 76 aa5.73□□□□□ -1.49
TRPS1-210ENST00000519815 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.73□□□□□ -1.49
TRPS1-210ENST00000519815 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.73□□□□□ -1.49
TRPS1-210ENST00000519815 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-210ENST00000519815 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-210ENST00000519815 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-210ENST00000519815 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-210ENST00000519815 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-210ENST00000519815 A8MUU9 505 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-210ENST00000519815 FAM236CP0DP71 79 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-210ENST00000519815 TPRXLQ17RH7 258 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-210ENST00000519815 C4orf26Q17RF5 130 aa5.65□□□□□ -1.5
TRPS1-210ENST00000519815 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.64□□□□□ -1.51
TRPS1-210ENST00000519815 MP68P56378 58 aa5.64□□□□□ -1.51
TRPS1-210ENST00000519815 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRPS1-210ENST00000519815 H0Y9P7 68 aa5.63□□□□□ -1.51
TRPS1-210ENST00000519815 KLKP1Q107X0 134 aa5.63□□□□□ -1.51
TRPS1-210ENST00000519815 PRO0628Q9UI54 55 aa5.63□□□□□ -1.51
TRPS1-210ENST00000519815 Q5W150 140 aa5.62□□□□□ -1.51
TRPS1-210ENST00000519815 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TRPS1-210ENST00000519815 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.61□□□□□ -1.51
TRPS1-210ENST00000519815 H3BPC8 53 aa5.61□□□□□ -1.51
TRPS1-210ENST00000519815 H7BZZ5 65 aa5.61□□□□□ -1.51
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