RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514834.1

ITGA3-214, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-214ENST00000514834 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.72□□□□□ -1.17
ITGA3-214ENST00000514834 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.71□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 LIMD2Q9BT23 127 aa7.71□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 ATOX1O00244 68 aa7.7□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.7□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 Q5XG85 94 aa7.69□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 IGFL1Q6UW32 110 aa7.68□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.68□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 CXCL6P80162 114 aa7.66□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.66□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 Q6ZVQ6 151 aa7.66□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
ITGA3-214ENST00000514834 A0A0U1RQV1 116 aa7.64□□□□□ -1.19
ITGA3-214ENST00000514834 NREPQ16612 68 aa7.63□□□□□ -1.19
ITGA3-214ENST00000514834 XP32Q5T750 250 aa7.63□□□□□ -1.19
ITGA3-214ENST00000514834 UQCRQO14949 82 aa7.61□□□□□ -1.19
ITGA3-214ENST00000514834 A0A1W2PNM2 257 aa7.6□□□□□ -1.19
ITGA3-214ENST00000514834 C9orf92A6NGG3 77 aa7.59□□□□□ -1.19
ITGA3-214ENST00000514834 C1orf195Q5TG92 126 aa7.59□□□□□ -1.19
ITGA3-214ENST00000514834 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.59□□□□□ -1.19
ITGA3-214ENST00000514834 J3KT08 172 aa7.58□□□□□ -1.2
ITGA3-214ENST00000514834 COX7CP15954 63 aa7.58□□□□□ -1.2
ITGA3-214ENST00000514834 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ITGA3-214ENST00000514834 A0A087WSZ3 146 aa7.57□□□□□ -1.2
ITGA3-214ENST00000514834 A0A087WVE0 104 aa7.57□□□□□ -1.2
ITGA3-214ENST00000514834 CCDC179H3BU77 68 aa7.57□□□□□ -1.2
ITGA3-214ENST00000514834 SERP2Q8N6R1 65 aa7.57□□□□□ -1.2
ITGA3-214ENST00000514834 BPY2O14599 106 aa7.55□□□□□ -1.2
ITGA3-214ENST00000514834 NDUFB1O75438 58 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA3-214ENST00000514834 PCOTHQ58A44 107 aa7.51□□□□□ -1.21
ITGA3-214ENST00000514834 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA3-214ENST00000514834 LCE2CQ5TA81 110 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGA3-214ENST00000514834 IGKV4-1P06312 121 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGA3-214ENST00000514834 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGA3-214ENST00000514834 Q96NJ1 140 aa7.43□□□□□ -1.22
ITGA3-214ENST00000514834 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.42□□□□□ -1.22
ITGA3-214ENST00000514834 A8MWP4 228 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGA3-214ENST00000514834 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGA3-214ENST00000514834 TMEM258P61165 79 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA3-214ENST00000514834 Q8N9L7 120 aa7.38□□□□□ -1.23
ITGA3-214ENST00000514834 C8orf87E5RJ46 101 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGA3-214ENST00000514834 PRR15Q8IV56 129 aa7.37□□□□□ -1.23
ITGA3-214ENST00000514834 DSCR10P59022 87 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGA3-214ENST00000514834 C20orf197Q8N268 126 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGA3-214ENST00000514834 NDUFC1O43677 76 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGA3-214ENST00000514834 A0A1B0GVX0 72 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-214ENST00000514834 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA3-214ENST00000514834 HCG22E2RYF7 251 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGA3-214ENST00000514834 K7EQZ3 153 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGA3-214ENST00000514834 MT1HP80294 61 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGA3-214ENST00000514834 KLKP1Q107X0 134 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00313P59037 77 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-214ENST00000514834 OCR1Q9BZK8 76 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGA3-214ENST00000514834 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGA3-214ENST00000514834 Q75L30 129 aa7.3□□□□□ -1.24
ITGA3-214ENST00000514834 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGA3-214ENST00000514834 hDV103S1A0JD37 113 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 CASC2Q6XLA1 102 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 A8MUU9 505 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 FAM236CP0DP71 79 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 C5orf47Q569G3 176 aa7.25□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 SNURFQ9Y675 71 aa7.24□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.23□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 H7BZZ5 65 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.22□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ITGA3-214ENST00000514834 MP68P56378 58 aa7.21□□□□□ -1.26
ITGA3-214ENST00000514834 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ITGA3-214ENST00000514834 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.2□□□□□ -1.26
ITGA3-214ENST00000514834 H3BPC8 53 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGA3-214ENST00000514834 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.19□□□□□ -1.26
ITGA3-214ENST00000514834 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ITGA3-214ENST00000514834 NDUFS5O43920 106 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGA3-214ENST00000514834 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-214ENST00000514834 M0R2T5 61 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-214ENST00000514834 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-214ENST00000514834 H0Y9P7 68 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-214ENST00000514834 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-214ENST00000514834 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.08□□□□□ -1.28
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00208Q96KT6 92 aa7.07□□□□□ -1.28
ITGA3-214ENST00000514834 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA3-214ENST00000514834 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.04□□□□□ -1.28
ITGA3-214ENST00000514834 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.02□□□□□ -1.29
ITGA3-214ENST00000514834 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.01□□□□□ -1.29
ITGA3-214ENST00000514834 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms