RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193		A0A087X002	238 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GU33	70 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	PDZD2	O15018	2839 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZR54	194 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193		J3QL48	77 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	CUBN	O60494	3623 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NEK1-208	ENST00000512193	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NEK1-208	ENST00000512193	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NEK1-208	ENST00000512193	VWF	P04275	2813 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NEK1-208	ENST00000512193	LCE6A	A0A183	80 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NEK1-208	ENST00000512193	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NEK1-208	ENST00000512193	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NEK1-208	ENST00000512193		A8MU10	97 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZSA8	131 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NEK1-208	ENST00000512193	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NEK1-208	ENST00000512193	TG	P01266	2768 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEK1-208	ENST00000512193	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEK1-208	ENST00000512193	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEK1-208	ENST00000512193	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEK1-208	ENST00000512193		S4R3F8	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEK1-208	ENST00000512193		H3BS24	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEK1-208	ENST00000512193	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEK1-208	ENST00000512193		Q5VSD8	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEK1-208	ENST00000512193	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEK1-208	ENST00000512193		A6NN06	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEK1-208	ENST00000512193	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NEK1-208	ENST00000512193	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NEK1-208	ENST00000512193	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEK1-208	ENST00000512193	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NEK1-208	ENST00000512193	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NEK1-208	ENST00000512193	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NEK1-208	ENST00000512193	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.5	□□□□□ -1.69
NEK1-208	ENST00000512193		R4GN34	69 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NEK1-208	ENST00000512193	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
NEK1-208	ENST00000512193	ROMO1	P60602	79 aa		4.48	□□□□□ -1.69
NEK1-208	ENST00000512193	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
NEK1-208	ENST00000512193	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.44	□□□□□ -1.7
NEK1-208	ENST00000512193		M0QZ58	72 aa		4.43	□□□□□ -1.7
NEK1-208	ENST00000512193	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.43	□□□□□ -1.7
NEK1-208	ENST00000512193	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.42	□□□□□ -1.7
NEK1-208	ENST00000512193		M0R2T5	61 aa		4.41	□□□□□ -1.7
NEK1-208	ENST00000512193		A8MUU9	505 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NEK1-208	ENST00000512193	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NEK1-208	ENST00000512193	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.33	□□□□□ -1.72
NEK1-208	ENST00000512193	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.32	□□□□□ -1.72
NEK1-208	ENST00000512193	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEK1-208	ENST00000512193	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.3	□□□□□ -1.72
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NEK1-208	ENST00000512193		H0YAA0	97 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NEK1-208	ENST00000512193	XP32	Q5T750	250 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NEK1-208	ENST00000512193	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0A0MQY5	61 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEK1-208	ENST00000512193	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NEK1-208	ENST00000512193	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NEK1-208	ENST00000512193		P0C880	135 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NEK1-208	ENST00000512193	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GVY2	172 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NEK1-208	ENST00000512193	TNP1	P09430	55 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NEK1-208	ENST00000512193	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NEK1-208	ENST00000512193	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NEK1-208	ENST00000512193	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP10-10	P60014	251 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NEK1-208	ENST00000512193	AKAP9	Q99996	3911 aa		3.89	□□□□□ -1.79
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEK1-208	ENST00000512193	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEK1-208	ENST00000512193	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		3.78	□□□□□ -1.81
NEK1-208	ENST00000512193	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NEK1-208	ENST00000512193	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEK1-208	ENST00000512193	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEK1-208	ENST00000512193	DNHD1	Q96M86	4753 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEK1-208	ENST00000512193	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEK1-208	ENST00000512193	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		3.71	□□□□□ -1.81

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