RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 CREBBPQ92793 2442 aa0.23□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 FLNCQ14315 2725 aa0.22□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 LINC01546A6NGU7 62 aa0.22□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.22□□□□□ -2.37
HERC3-209ENST00000504994 ABCC8Q09428 1581 aa0.21□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 LYSTQ99698 3801 aa0.21□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.21□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa0.2□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 NBASA2RRP1 2371 aa0.19□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 TOMM5Q8N4H5 51 aa0.19□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa0.18□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa0.18□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.18□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 TENM2Q9NT68 2774 aa0.17□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 PKD1P98161 4303 aa0.17□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.17□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.17□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 CEP290O15078 2479 aa0.16□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 LRP2P98164 4655 aa0.16□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 PDZD2O15018 2839 aa0.16□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 SPRR2AP35326 72 aa0.16□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.16□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.16□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.15□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.38
HERC3-209ENST00000504994 COL6A3P12111 3177 aa0.15□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 DNAH7Q8WXX0 4024 aa0.15□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 DNAH3Q8TD57 4116 aa0.15□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 PKHD1P08F94 4074 aa0.14□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 M0QY20 66 aa0.14□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 DEFB110Q30KQ9 67 aa0.14□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 LMO7Q8WWI1 1683 aa0.14□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa0.13□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa0.13□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 ZZEF1O43149 2961 aa0.13□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa0.13□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 AKAP9Q99996 3911 aa0.13□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 DNAH6Q9C0G6 4158 aa0.12□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 DEFB131AP59861 70 aa0.12□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa0.12□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 DNAH9Q9NYC9 4486 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 VPS13DQ5THJ4 4388 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 TACC2O95359 2948 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 ZANQ9Y493 2812 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 A8MTW9 85 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 TNP1P09430 55 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 KIF21BO75037 1637 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 CMYA5Q8N3K9 4069 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 DNAH8Q96JB1 4490 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 KALRNO60229 2985 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa0.11□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa0.1□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa0.1□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 MTORP42345 2549 aa0.1□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 MT1AP04731 61 aa0.1□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 DNAH2Q9P225 4427 aa0.1□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 STAB1Q9NY15 2570 aa0.09□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 TGP01266 2768 aa0.09□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 NBEAQ8NFP9 2946 aa0.09□□□□□ -2.39
HERC3-209ENST00000504994 M0QZ58 72 aa0.09□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 NDUFA1O15239 70 aa0.09□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 DNAH10Q8IVF4 4471 aa0.09□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 HIVEP1P15822 2718 aa0.08□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 SSPOA2VEC9 5147 aa0.08□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 FAT1Q14517 4588 aa0.08□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 SPRR2EP22531 72 aa0.08□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 DNAH11Q96DT5 4516 aa0.08□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.08□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 FASNP49327 2511 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa0.08□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 DNAH17Q9UFH2 4485 aa0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 SPG11Q96JI7 2443 aa0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 HYDINQ4G0P3 5121 aa0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 MUC2Q02817 5179 aa0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 UBR4Q5T4S7 5183 aa0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 LAMA5O15230 3695 aa0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 A0A1B0GUL6 1792 aa0.06□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 DNAH5Q8TE73 4624 aa0.06□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 HERC1Q15751 4861 aa0.06□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.06□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 STARD9Q9P2P6 4700 aa0.06□□□□□ -2.4
HERC3-209ENST00000504994 ITPR3Q14573 2671 aa0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms