RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 HERC1Q15751 4861 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 CASC2Q6XLA1 102 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM229AH3BQW9 127 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 J3QL48 77 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFB1O75438 58 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFC1O43677 76 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 C5orf47Q569G3 176 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 Q5XG85 94 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GVX0 72 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 FAT1Q14517 4588 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 hDV103S1A0JD37 113 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM236CP0DP71 79 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf195Q5TG92 126 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 MYCBP2O75592 4640 aa6.19□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BPC8 53 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 MP68P56378 58 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 C8orf87E5RJ46 101 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 H0Y9P7 68 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 SPINK1P00995 79 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 OXTP01178 125 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 LIMD2Q9BT23 127 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00208Q96KT6 92 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00313P59037 77 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFS5O43920 106 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP2-209ENST00000504450 Q5W150 140 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP2-209ENST00000504450 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP2-209ENST00000504450 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM26A0A096LP01 95 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP10-8P60410 259 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR4Q16378 134 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 SVIPQ8NHG7 77 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 PCOTHQ58A44 107 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV2-30P06310 120 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP2-209ENST00000504450 MT1HL1P0DM35 61 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP2-209ENST00000504450 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MUU9 505 aa5.91□□□□□ -1.46
SH3BP2-209ENST00000504450 C4orf26Q17RF5 130 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP2-209ENST00000504450 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.9□□□□□ -1.46
SH3BP2-209ENST00000504450 TNXBP22105 4242 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP2-209ENST00000504450 HRES1P13985 223 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf92A6NGG3 77 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP2-209ENST00000504450 COA5Q86WW8 74 aa5.86□□□□□ -1.47
SH3BP2-209ENST00000504450 Q1T7F1 81 aa5.85□□□□□ -1.47
SH3BP2-209ENST00000504450 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP2-209ENST00000504450 DMAC1Q96GE9 116 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP2-209ENST00000504450 Q75L30 129 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2-209ENST00000504450 ACYP2P14621 99 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2-209ENST00000504450 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2-209ENST00000504450 LRP2P98164 4655 aa5.78□□□□□ -1.48
SH3BP2-209ENST00000504450 V9GYY9 64 aa5.78□□□□□ -1.48
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF213Q63HN8 5207 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.72□□□□□ -1.49
SH3BP2-209ENST00000504450 SPINK7P58062 85 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 XP32Q5T750 250 aa5.71□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MUN3 132 aa5.7□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 PSPHP1O15172 72 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 Q5VV11 94 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.67□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR15LQ9BU68 103 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 LPAP08519 4548 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP2-209ENST00000504450 TPRXLQ17RH7 258 aa5.62□□□□□ -1.51
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