RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 TPRXLQ17RH7 258 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-204ENST00000503638 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf92A6NGG3 77 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 PDE6GP18545 87 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 MUC2Q02817 5179 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZQT0 140 aa7.45□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 SIGMAR1Q99720 223 aa7.44□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.43□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.43□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.42□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 PRO0461Q9UI25 63 aa7.41□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV4-1P06312 121 aa7.4□□□□□ -1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 F8W1H4 67 aa7.39□□□□□ -1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 Q96NJ1 140 aa7.37□□□□□ -1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GW54 56 aa7.36□□□□□ -1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GV90 55 aa7.35□□□□□ -1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 NREPQ16612 68 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 ETDBQ3ZM63 59 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.34□□□□□ -1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 J3KT08 172 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 DSCR10P59022 87 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFB1O75438 58 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00313P59037 77 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GVX0 72 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 UBL5Q9BZL1 73 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 A8MWP4 228 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 BPY2O14599 106 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZVQ6 151 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 PCOTHQ58A44 107 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 C8orf87E5RJ46 101 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00846Q9NV44 126 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.21□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.21□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0U1RQV1 116 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.2□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 Q75L30 129 aa7.19□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 K7EQZ3 153 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR15Q8IV56 129 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.17□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8N9L7 120 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 MUC17Q685J3 4493 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 A8MUU9 505 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 ACYP1P07311 99 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.1□□□□□ -1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 hDV103S1A0JD37 113 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFS5O43920 106 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.09□□□□□ -1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 J3QR89 54 aa7.08□□□□□ -1.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CXCL6P80162 114 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CASC2Q6XLA1 102 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PGGT1B-204ENST00000503638 HCG22E2RYF7 251 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-204ENST00000503638 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-204ENST00000503638 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00643Q86TS7 51 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-204ENST00000503638 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-204ENST00000503638 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1B-204ENST00000503638 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.94□□□□□ -1.3
PGGT1B-204ENST00000503638 K7ERU9 68 aa6.93□□□□□ -1.3
PGGT1B-204ENST00000503638 SPINK7P58062 85 aa6.91□□□□□ -1.3
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A087WVE0 104 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM236CP0DP71 79 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV2-30P06310 120 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-204ENST00000503638 Q5W150 140 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-204ENST00000503638 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-204ENST00000503638 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.83□□□□□ -1.32
PGGT1B-204ENST00000503638 HRES1P13985 223 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.82□□□□□ -1.32
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R2T5 61 aa6.8□□□□□ -1.32
PGGT1B-204ENST00000503638 SCGB1A1P11684 91 aa6.78□□□□□ -1.32
PGGT1B-204ENST00000503638 MT-ATP8P03928 68 aa6.77□□□□□ -1.33
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-204ENST00000503638 UQCRQO14949 82 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-204ENST00000503638 MT1HP80294 61 aa6.76□□□□□ -1.33
PGGT1B-204ENST00000503638 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.74□□□□□ -1.33
PGGT1B-204ENST00000503638 H0Y9P7 68 aa6.73□□□□□ -1.33
PGGT1B-204ENST00000503638 IMUPQ9GZP8 106 aa6.72□□□□□ -1.33
PGGT1B-204ENST00000503638 ATOX1O00244 68 aa6.71□□□□□ -1.34
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