RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492766.5

RERE-215, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 3

Gene RERE, Length 367 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-215ENST00000492766 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.23□□□□□ -1.25
RERE-215ENST00000492766 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.23□□□□□ -1.25
RERE-215ENST00000492766 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.23□□□□□ -1.25
RERE-215ENST00000492766 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.23□□□□□ -1.25
RERE-215ENST00000492766 A0A1B0GVX0 72 aa7.22□□□□□ -1.25
RERE-215ENST00000492766 A8MUU9 505 aa7.22□□□□□ -1.25
RERE-215ENST00000492766 J3KT08 172 aa7.22□□□□□ -1.25
RERE-215ENST00000492766 LINC00313P59037 77 aa7.22□□□□□ -1.25
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RERE-215ENST00000492766 C8orf87E5RJ46 101 aa7.19□□□□□ -1.26
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RERE-215ENST00000492766 A8MWP4 228 aa7.17□□□□□ -1.26
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RERE-215ENST00000492766 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.15□□□□□ -1.26
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RERE-215ENST00000492766 ETDBQ3ZM63 59 aa7.13□□□□□ -1.27
RERE-215ENST00000492766 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RERE-215ENST00000492766 Q6ZVQ6 151 aa7.12□□□□□ -1.27
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RERE-215ENST00000492766 BPY2O14599 106 aa7.08□□□□□ -1.28
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RERE-215ENST00000492766 A0A1B0GV90 55 aa7.05□□□□□ -1.28
RERE-215ENST00000492766 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RERE-215ENST00000492766 UBL5Q9BZL1 73 aa7.05□□□□□ -1.28
RERE-215ENST00000492766 Q8N9L7 120 aa7.04□□□□□ -1.28
RERE-215ENST00000492766 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.03□□□□□ -1.28
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RERE-215ENST00000492766 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.99□□□□□ -1.29
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RERE-215ENST00000492766 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.97□□□□□ -1.29
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RERE-215ENST00000492766 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.94□□□□□ -1.3
RERE-215ENST00000492766 HRES1P13985 223 aa6.94□□□□□ -1.3
RERE-215ENST00000492766 CASC2Q6XLA1 102 aa6.94□□□□□ -1.3
RERE-215ENST00000492766 NDUFS5O43920 106 aa6.93□□□□□ -1.3
RERE-215ENST00000492766 CXCL6P80162 114 aa6.93□□□□□ -1.3
RERE-215ENST00000492766 ACYP1P07311 99 aa6.92□□□□□ -1.3
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RERE-215ENST00000492766 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.91□□□□□ -1.3
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RERE-215ENST00000492766 M0R2T5 61 aa6.86□□□□□ -1.31
RERE-215ENST00000492766 Q5W150 140 aa6.86□□□□□ -1.31
RERE-215ENST00000492766 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.85□□□□□ -1.31
RERE-215ENST00000492766 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.84□□□□□ -1.31
RERE-215ENST00000492766 FAM236CP0DP71 79 aa6.84□□□□□ -1.31
RERE-215ENST00000492766 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.84□□□□□ -1.31
RERE-215ENST00000492766 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RERE-215ENST00000492766 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.81□□□□□ -1.32
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RERE-215ENST00000492766 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.79□□□□□ -1.32
RERE-215ENST00000492766 IGKV2-30P06310 120 aa6.79□□□□□ -1.32
RERE-215ENST00000492766 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.78□□□□□ -1.32
RERE-215ENST00000492766 LINC00643Q86TS7 51 aa6.78□□□□□ -1.32
RERE-215ENST00000492766 J3QR89 54 aa6.75□□□□□ -1.33
RERE-215ENST00000492766 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RERE-215ENST00000492766 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.74□□□□□ -1.33
RERE-215ENST00000492766 A0A087WVE0 104 aa6.72□□□□□ -1.33
RERE-215ENST00000492766 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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RERE-215ENST00000492766 C4orf26Q17RF5 130 aa6.64□□□□□ -1.35
RERE-215ENST00000492766 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.63□□□□□ -1.35
RERE-215ENST00000492766 UQCRQO14949 82 aa6.62□□□□□ -1.35
RERE-215ENST00000492766 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.62□□□□□ -1.35
RERE-215ENST00000492766 K7ERU9 68 aa6.6□□□□□ -1.35
RERE-215ENST00000492766 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.59□□□□□ -1.35
RERE-215ENST00000492766 H0Y9P7 68 aa6.58□□□□□ -1.36
RERE-215ENST00000492766 MT2AP02795 61 aa6.58□□□□□ -1.36
RERE-215ENST00000492766 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.58□□□□□ -1.36
RERE-215ENST00000492766 OCR1Q9BZK8 76 aa6.57□□□□□ -1.36
RERE-215ENST00000492766 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.56□□□□□ -1.36
RERE-215ENST00000492766 ATOX1O00244 68 aa6.55□□□□□ -1.36
RERE-215ENST00000492766 MT-ATP8P03928 68 aa6.55□□□□□ -1.36
RERE-215ENST00000492766 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.54□□□□□ -1.36
RERE-215ENST00000492766 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.54□□□□□ -1.36
RERE-215ENST00000492766 MT1FP04733 61 aa6.53□□□□□ -1.36
RERE-215ENST00000492766 IMUPQ9GZP8 106 aa6.51□□□□□ -1.37
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RERE-215ENST00000492766 MP68P56378 58 aa6.47□□□□□ -1.37
RERE-215ENST00000492766 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.47□□□□□ -1.37
RERE-215ENST00000492766 S4R3F8 94 aa6.47□□□□□ -1.37
RERE-215ENST00000492766 SCGB1A1P11684 91 aa6.46□□□□□ -1.38
RERE-215ENST00000492766 KRTAP10-10P60014 251 aa6.46□□□□□ -1.38
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RERE-215ENST00000492766 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.44□□□□□ -1.38
RERE-215ENST00000492766 C5orf47Q569G3 176 aa6.44□□□□□ -1.38
RERE-215ENST00000492766 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.43□□□□□ -1.38
RERE-215ENST00000492766 KLKP1Q107X0 134 aa6.43□□□□□ -1.38
RERE-215ENST00000492766 LCA10Q71F78 164 aa6.43□□□□□ -1.38
RERE-215ENST00000492766 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.42□□□□□ -1.38
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RERE-215ENST00000492766 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.37□□□□□ -1.39
RERE-215ENST00000492766 CSAG1Q6PB30 78 aa6.36□□□□□ -1.39
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