RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489095.1

TRBV5-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV5-2, Length 273 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.53□□□□□ -1.84
TRBV5-2-201ENST00000489095 H0Y9P7 68 aa3.53□□□□□ -1.84
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP10-1P60331 282 aa3.53□□□□□ -1.84
TRBV5-2-201ENST00000489095 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.53□□□□□ -1.84
TRBV5-2-201ENST00000489095 Q5XG85 94 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 KMT2AQ03164 3969 aa3.52□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 DNAH2Q9P225 4427 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 C8orf87E5RJ46 101 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 OXTP01178 125 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.51□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 LINC00208Q96KT6 92 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 LIMD2Q9BT23 127 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 A0A087X002 238 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 NDUFS5O43920 106 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV5-2-201ENST00000489095 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 PKD1P98161 4303 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 SPINK1P00995 79 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 LINC00313P59037 77 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 C1orf195Q5TG92 126 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 SVIPQ8NHG7 77 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 A0A1B0GVY2 172 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 C4orf26Q17RF5 130 aa3.42□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.42□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 V9GYY9 64 aa3.42□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 Q1T7F1 81 aa3.41□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.41□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 LCE1DQ5T752 114 aa3.41□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.41□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.41□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.41□□□□□ -1.86
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRR4Q16378 134 aa3.4□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 PCOTHQ58A44 107 aa3.39□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.38□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.38□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 Q5W150 140 aa3.37□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 COA5Q86WW8 74 aa3.37□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.37□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 PKHD1P08F94 4074 aa3.36□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 H3BS24 57 aa3.36□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 IGKV2-30P06310 120 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRO0628Q9UI54 55 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV5-2-201ENST00000489095 ACYP2P14621 99 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 DMAC1Q96GE9 116 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 HRES1P13985 223 aa3.32□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.32□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.31□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 LCE4AQ5TA78 99 aa3.31□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 PSPHP1O15172 72 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 BRK1Q8WUW1 75 aa3.3□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 A8MUN3 132 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 A8MUU9 505 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 Q75L30 129 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRR15LQ9BU68 103 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 RYR2Q92736 4967 aa3.29□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 Q5VV11 94 aa3.28□□□□□ -1.88
TRBV5-2-201ENST00000489095 Q5VSD8 79 aa3.27□□□□□ -1.89
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.27□□□□□ -1.89
TRBV5-2-201ENST00000489095 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.27□□□□□ -1.89
TRBV5-2-201ENST00000489095 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
TRBV5-2-201ENST00000489095 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP10-8P60410 259 aa3.25□□□□□ -1.89
TRBV5-2-201ENST00000489095 C9orf92A6NGG3 77 aa3.24□□□□□ -1.89
TRBV5-2-201ENST00000489095 A6NED7 52 aa3.23□□□□□ -1.89
TRBV5-2-201ENST00000489095 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.23□□□□□ -1.89
TRBV5-2-201ENST00000489095 Q8N1X5 172 aa3.22□□□□□ -1.89
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.21□□□□□ -1.9
TRBV5-2-201ENST00000489095 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms