RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488985.1

RPS6KA1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, human

TSL 3

Gene RPS6KA1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985		A0A087WSZ3	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985		K7EQZ3	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985		V9GYY9	64 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PRLH	P81277	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MOBP	Q13875	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985		Q1T7F1	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CD164	Q04900	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ZNF861P	O60384	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS6KA1-208	ENST00000488985		H0Y9P7	68 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985		A0A1B0GVX0	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TNXB	P22105	4242 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS6KA1-208	ENST00000488985	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-208	ENST00000488985		Q96NJ1	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-208	ENST00000488985		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-208	ENST00000488985	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-208	ENST00000488985	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-208	ENST00000488985	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS6KA1-208	ENST00000488985	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-208	ENST00000488985	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LRP2	P98164	4655 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-208	ENST00000488985	NDUFS5	O43920	106 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-208	ENST00000488985		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-208	ENST00000488985	COA5	Q86WW8	74 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PRR4	Q16378	134 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ACYP2	P14621	99 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985		Q75L30	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LINC00313	P59037	77 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985		A0A087X002	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PSPHP1	O15172	72 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985		Q5VV11	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985		A8MUN3	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SPINK1	P00995	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPS6KA1-208	ENST00000488985	HRES1	P13985	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-208	ENST00000488985	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LPA	P08519	4548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-208	ENST00000488985	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-208	ENST00000488985	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-208	ENST00000488985	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-208	ENST00000488985		A6NED7	52 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-208	ENST00000488985	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-208	ENST00000488985	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-208	ENST00000488985		Q5W150	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS6KA1-208	ENST00000488985	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS6KA1-208	ENST00000488985	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS6KA1-208	ENST00000488985	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPS6KA1-208	ENST00000488985	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPS6KA1-208	ENST00000488985	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPS6KA1-208	ENST00000488985	LCA10	Q71F78	164 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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