RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487530.2

LYST-210, Transcript of lysosomal trafficking regulator, humanhuman

TSL 4

Gene LYST, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYST-210ENST00000487530 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 RGPD5Q99666 1765 aa-1.44□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 WIZO95785 1651 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 C5P01031 1676 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 SHPRHQ149N8 1683 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 UBR3Q6ZT12 1888 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 ATOX1O00244 68 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 DEPDC5O75140 1603 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 NCOA2Q15596 1464 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 TEX14Q8IWB6 1497 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 CROCC2H7BZ55 1655 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-1.45□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-1.46□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-1.46□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 IFI6P09912 130 aa-1.46□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-1.46□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 QSER1Q2KHR3 1735 aa-1.46□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.47□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 CD52P31358 61 aa-1.47□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 CHD1O14646 1710 aa-1.47□□□□□ -2.64
LYST-210ENST00000487530 PLIN4Q96Q06 1357 aa-1.47□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-1.48□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 M0QY20 66 aa-1.48□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 FAUP35544 74 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 C2orf88Q9BSF0 95 aa-1.48□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 UBR1Q8IWV7 1749 aa-1.49□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 MED14O60244 1454 aa-1.49□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.49□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-1.49□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 WT1-ASQ06250 92 aa-1.49□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 KIF21BO75037 1637 aa-1.49□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 LY75O60449 1722 aa-1.49□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-1.49□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-1.5□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 S100PP25815 95 aa-1.5□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 GAFA1Q96PS6 74 aa-1.5□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 ABCA3Q99758 1704 aa-1.5□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 NESP48681 1621 aa-1.51□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 ACYP1P07311 99 aa-1.51□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 S100A10P60903 97 aa-1.51□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 DEFB133Q30KQ1 61 aa-1.51□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 H3BUA1 57 aa-1.52□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 NWD1Q149M9 1564 aa-1.52□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-1.52□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-1.52□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 IQCF6A8MYZ5 107 aa-1.53□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 LINC00032P0C843 101 aa-1.53□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-1.53□□□□□ -2.65
LYST-210ENST00000487530 RGPD1P0DJD0 1748 aa-1.54□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 VPS8Q8N3P4 1428 aa-1.54□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 A0A1B0GUT8 65 aa-1.54□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-1.54□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 LMO7Q8WWI1 1683 aa-1.55□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-1.55□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 LINC00587B1AMM8 73 aa-1.55□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 CYB5AP00167 134 aa-1.55□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-1.56□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 SMIM11AP58511 58 aa-1.56□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 KIF1AQ12756 1690 aa-1.57□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-1.57□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 SFTA3P0C7M3 94 aa-1.57□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 PLGLAQ15195 96 aa-1.57□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 GLI2P10070 1586 aa-1.57□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-1.57□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-1.57□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-1.58□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 A0A1B0GUL6 1792 aa-1.58□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-1.58□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-1.59□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-1.59□□□□□ -2.66
LYST-210ENST00000487530 DEFB121Q5J5C9 76 aa-1.6□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 DPY30Q9C005 99 aa-1.6□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 HTN1P15515 57 aa-1.61□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 PEA15Q15121 130 aa-1.61□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 TDRG1Q3Y452 100 aa-1.61□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-1.61□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-1.61□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-1.61□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 NFAT5O94916 1531 aa-1.61□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 DIP2BQ9P265 1576 aa-1.62□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-1.62□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 NDUFA4O00483 81 aa-1.62□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 FCER1GP30273 86 aa-1.62□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 LINC01556Q5JQF7 62 aa-1.62□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 MYH4Q9Y623 1939 aa-1.62□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 LTN1O94822 1766 aa-1.62□□□□□ -2.67
LYST-210ENST00000487530 ITSN1Q15811 1721 aa-1.63□□□□□ -2.67
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