RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 PRLHP81277 87 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.91□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.9□□□□□ -1.46
POLR1A-208ENST00000486964 PKHD1P08F94 4074 aa5.9□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZSA8 131 aa5.9□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.9□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 A8MWP4 228 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 PRR15Q8IV56 129 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 V9GYY9 64 aa5.89□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-1P60331 282 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 CASC2Q6XLA1 102 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GVY2 172 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 Q1T7F1 81 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 H0Y9P7 68 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 BRK1Q8WUW1 75 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
POLR1A-208ENST00000486964 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 MOBPQ13875 183 aa5.82□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00208Q96KT6 92 aa5.82□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.82□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.82□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.81□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.81□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf195Q5TG92 126 aa5.81□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0G2JQZ4 141 aa5.8□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00483Q53H64 154 aa5.8□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.78□□□□□ -1.48
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF861PO60384 105 aa5.77□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 CDK2AP2O75956 126 aa5.76□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 LIMD2Q9BT23 127 aa5.76□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV7-43P04211 117 aa5.75□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.75□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 HERC1Q15751 4861 aa5.75□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 HSPG2P98160 4391 aa5.74□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.74□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.73□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 PRR4Q16378 134 aa5.73□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.73□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.72□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GVX0 72 aa5.72□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 Q96NJ1 140 aa5.72□□□□□ -1.49
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1A-208ENST00000486964 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1A-208ENST00000486964 PSPHP1O15172 72 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1A-208ENST00000486964 COA5Q86WW8 74 aa5.68□□□□□ -1.5
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POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
POLR1A-208ENST00000486964 CD164Q04900 197 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1A-208ENST00000486964 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
POLR1A-208ENST00000486964 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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POLR1A-208ENST00000486964 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFS5O43920 106 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1A-208ENST00000486964 Q5VV11 94 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1A-208ENST00000486964 Q75L30 129 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1A-208ENST00000486964 C8orf87E5RJ46 101 aa5.65□□□□□ -1.51
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.65□□□□□ -1.51
POLR1A-208ENST00000486964 PRR15LQ9BU68 103 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1A-208ENST00000486964 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1A-208ENST00000486964 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.63□□□□□ -1.51
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.63□□□□□ -1.51
POLR1A-208ENST00000486964 FAT1Q14517 4588 aa5.62□□□□□ -1.51
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POLR1A-208ENST00000486964 PCOTHQ58A44 107 aa5.61□□□□□ -1.51
POLR1A-208ENST00000486964 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.61□□□□□ -1.51
POLR1A-208ENST00000486964 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.61□□□□□ -1.51
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.6□□□□□ -1.51
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POLR1A-208ENST00000486964 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.58□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087X002 238 aa5.57□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 A6NED7 52 aa5.57□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.57□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.57□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 MYCBP2O75592 4640 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 HRES1P13985 223 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 ACYP2P14621 99 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 Q8N1X5 172 aa5.53□□□□□ -1.52
POLR1A-208ENST00000486964 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1A-208ENST00000486964 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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