RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.8□□□□□ -1.32
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SDCCAG3-211ENST00000486441 HIST1H4GQ99525 98 aa6.76□□□□□ -1.33
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SDCCAG3-211ENST00000486441 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.63□□□□□ -1.35
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SDCCAG3-211ENST00000486441 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.63□□□□□ -1.35
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SDCCAG3-211ENST00000486441 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.54□□□□□ -1.36
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SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP5-9P26371 169 aa6.51□□□□□ -1.37
SDCCAG3-211ENST00000486441 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.51□□□□□ -1.37
SDCCAG3-211ENST00000486441 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.51□□□□□ -1.37
SDCCAG3-211ENST00000486441 A6NN06 94 aa6.5□□□□□ -1.37
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SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP10-5P60370 271 aa6.44□□□□□ -1.38
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SDCCAG3-211ENST00000486441 DSCR8Q96T75 97 aa6.43□□□□□ -1.38
SDCCAG3-211ENST00000486441 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SDCCAG3-211ENST00000486441 C9JAW5 83 aa6.4□□□□□ -1.38
SDCCAG3-211ENST00000486441 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.4□□□□□ -1.38
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SDCCAG3-211ENST00000486441 COX6CP09669 75 aa6.39□□□□□ -1.39
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SDCCAG3-211ENST00000486441 PRR15Q8IV56 129 aa6.38□□□□□ -1.39
SDCCAG3-211ENST00000486441 Q5VV11 94 aa6.37□□□□□ -1.39
SDCCAG3-211ENST00000486441 Q5W150 140 aa6.37□□□□□ -1.39
SDCCAG3-211ENST00000486441 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.36□□□□□ -1.39
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.36□□□□□ -1.39
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SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.34□□□□□ -1.39
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.34□□□□□ -1.39
SDCCAG3-211ENST00000486441 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.32□□□□□ -1.4
SDCCAG3-211ENST00000486441 C5orf47Q569G3 176 aa6.32□□□□□ -1.4
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.32□□□□□ -1.4
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.32□□□□□ -1.4
SDCCAG3-211ENST00000486441 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.31□□□□□ -1.4
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SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A1B0GW54 56 aa6.31□□□□□ -1.4
SDCCAG3-211ENST00000486441 IGKV2-30P06310 120 aa6.31□□□□□ -1.4
SDCCAG3-211ENST00000486441 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.3□□□□□ -1.4
SDCCAG3-211ENST00000486441 C4orf26Q17RF5 130 aa6.29□□□□□ -1.4
SDCCAG3-211ENST00000486441 IMUPQ9GZP8 106 aa6.29□□□□□ -1.4
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.27□□□□□ -1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.27□□□□□ -1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 hDV103S1A0JD37 113 aa6.27□□□□□ -1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.27□□□□□ -1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCDC179H3BU77 68 aa6.26□□□□□ -1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 K7EQZ3 153 aa6.25□□□□□ -1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.24□□□□□ -1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 H3BT86 120 aa6.24□□□□□ -1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 NDUFS5O43920 106 aa6.24□□□□□ -1.41
SDCCAG3-211ENST00000486441 ACYP1P07311 99 aa6.24□□□□□ -1.41
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