RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486420.1

C9orf16-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-202ENST00000486420 Q75L30 129 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf16-202ENST00000486420 MTURNQ8N3F0 131 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf16-202ENST00000486420 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf16-202ENST00000486420 PRO0461Q9UI25 63 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf16-202ENST00000486420 A0A1B0GVX0 72 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 MUC17Q685J3 4493 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 A8MWP4 228 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 UBL5Q9BZL1 73 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.67□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 A8MUU9 505 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 BPY2O14599 106 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 PCOTHQ58A44 107 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 DSCR10P59022 87 aa6.65□□□□□ -1.34
C9orf16-202ENST00000486420 ACYP1P07311 99 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf16-202ENST00000486420 ETDBQ3ZM63 59 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf16-202ENST00000486420 PRR15Q8IV56 129 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf16-202ENST00000486420 Q6ZVQ6 151 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf16-202ENST00000486420 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.61□□□□□ -1.35
C9orf16-202ENST00000486420 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.6□□□□□ -1.35
C9orf16-202ENST00000486420 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.59□□□□□ -1.35
C9orf16-202ENST00000486420 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
C9orf16-202ENST00000486420 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.58□□□□□ -1.36
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00846Q9NV44 126 aa6.57□□□□□ -1.36
C9orf16-202ENST00000486420 CXCL6P80162 114 aa6.56□□□□□ -1.36
C9orf16-202ENST00000486420 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.56□□□□□ -1.36
C9orf16-202ENST00000486420 hDV103S1A0JD37 113 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf16-202ENST00000486420 J3QR89 54 aa6.54□□□□□ -1.36
C9orf16-202ENST00000486420 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
C9orf16-202ENST00000486420 K7EQZ3 153 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf16-202ENST00000486420 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.53□□□□□ -1.36
C9orf16-202ENST00000486420 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf16-202ENST00000486420 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf16-202ENST00000486420 A0A1B0GV90 55 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf16-202ENST00000486420 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
C9orf16-202ENST00000486420 CASC2Q6XLA1 102 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf16-202ENST00000486420 NDUFS5O43920 106 aa6.47□□□□□ -1.37
C9orf16-202ENST00000486420 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.47□□□□□ -1.37
C9orf16-202ENST00000486420 HCG22E2RYF7 251 aa6.46□□□□□ -1.38
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf16-202ENST00000486420 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.45□□□□□ -1.38
C9orf16-202ENST00000486420 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.44□□□□□ -1.38
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00643Q86TS7 51 aa6.43□□□□□ -1.38
C9orf16-202ENST00000486420 Q8N9L7 120 aa6.42□□□□□ -1.38
C9orf16-202ENST00000486420 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.41□□□□□ -1.38
C9orf16-202ENST00000486420 SPINK7P58062 85 aa6.38□□□□□ -1.39
C9orf16-202ENST00000486420 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf16-202ENST00000486420 FAM236CP0DP71 79 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf16-202ENST00000486420 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf16-202ENST00000486420 K7ERU9 68 aa6.34□□□□□ -1.39
C9orf16-202ENST00000486420 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf16-202ENST00000486420 LCE2CQ5TA81 110 aa6.33□□□□□ -1.4
C9orf16-202ENST00000486420 HRES1P13985 223 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf16-202ENST00000486420 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.31□□□□□ -1.4
C9orf16-202ENST00000486420 M0R2T5 61 aa6.3□□□□□ -1.4
C9orf16-202ENST00000486420 MT1HP80294 61 aa6.29□□□□□ -1.4
C9orf16-202ENST00000486420 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.27□□□□□ -1.41
C9orf16-202ENST00000486420 ATOX1O00244 68 aa6.27□□□□□ -1.41
C9orf16-202ENST00000486420 IGKV2-30P06310 120 aa6.27□□□□□ -1.41
C9orf16-202ENST00000486420 UQCRQO14949 82 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf16-202ENST00000486420 Q5W150 140 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf16-202ENST00000486420 IMUPQ9GZP8 106 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf16-202ENST00000486420 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.25□□□□□ -1.41
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.25□□□□□ -1.41
C9orf16-202ENST00000486420 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf16-202ENST00000486420 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf16-202ENST00000486420 SCGB1A1P11684 91 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf16-202ENST00000486420 A0A087WVE0 104 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf16-202ENST00000486420 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf16-202ENST00000486420 MP68P56378 58 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf16-202ENST00000486420 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf16-202ENST00000486420 C5orf47Q569G3 176 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf16-202ENST00000486420 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf16-202ENST00000486420 H3BPC8 53 aa6.15□□□□□ -1.42
C9orf16-202ENST00000486420 H0Y9P7 68 aa6.14□□□□□ -1.43
C9orf16-202ENST00000486420 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.14□□□□□ -1.43
C9orf16-202ENST00000486420 C4orf26Q17RF5 130 aa6.11□□□□□ -1.43
C9orf16-202ENST00000486420 OCR1Q9BZK8 76 aa6.11□□□□□ -1.43
C9orf16-202ENST00000486420 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.1□□□□□ -1.43
C9orf16-202ENST00000486420 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.09□□□□□ -1.43
C9orf16-202ENST00000486420 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.07□□□□□ -1.44
C9orf16-202ENST00000486420 A8MUN3 132 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00208Q96KT6 92 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf16-202ENST00000486420 MT-ATP8P03928 68 aa6.05□□□□□ -1.44
C9orf16-202ENST00000486420 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf16-202ENST00000486420 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf16-202ENST00000486420 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf16-202ENST00000486420 S4R3F8 94 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf16-202ENST00000486420 CSAG1Q6PB30 78 aa5.99□□□□□ -1.45
C9orf16-202ENST00000486420 LCE2BO14633 110 aa5.97□□□□□ -1.45
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.97□□□□□ -1.45
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.95□□□□□ -1.46
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP10-10P60014 251 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms