RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481147.1

RBM17-211, Transcript of RNA binding motif protein 17, humanhuman

TSL 2

Gene RBM17, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17-211ENST00000481147 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM17-211ENST00000481147 hDV103S1A0JD37 113 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM17-211ENST00000481147 OCR1Q9BZK8 76 aa7.02□□□□□ -1.29
RBM17-211ENST00000481147 CCDC179H3BU77 68 aa7.01□□□□□ -1.29
RBM17-211ENST00000481147 KRTAP10-8P60410 259 aa7.01□□□□□ -1.29
RBM17-211ENST00000481147 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.01□□□□□ -1.29
RBM17-211ENST00000481147 LINC00313P59037 77 aa7□□□□□ -1.29
RBM17-211ENST00000481147 C5orf47Q569G3 176 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM17-211ENST00000481147 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM17-211ENST00000481147 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM17-211ENST00000481147 FAT1Q14517 4588 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM17-211ENST00000481147 RYR1P21817 5038 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM17-211ENST00000481147 C20orf197Q8N268 126 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM17-211ENST00000481147 OXTP01178 125 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM17-211ENST00000481147 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM17-211ENST00000481147 MP68P56378 58 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM17-211ENST00000481147 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM17-211ENST00000481147 H3BPC8 53 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM17-211ENST00000481147 NDUFS5O43920 106 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM17-211ENST00000481147 KLKP1Q107X0 134 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM17-211ENST00000481147 HSPG2P98160 4391 aa6.91□□□□□ -1.3
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RBM17-211ENST00000481147 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM17-211ENST00000481147 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM17-211ENST00000481147 A0A0U1RQV1 116 aa6.88□□□□□ -1.31
RBM17-211ENST00000481147 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RBM17-211ENST00000481147 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM17-211ENST00000481147 H0Y9P7 68 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM17-211ENST00000481147 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RBM17-211ENST00000481147 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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RBM17-211ENST00000481147 MT1HL1P0DM35 61 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM17-211ENST00000481147 LINC00208Q96KT6 92 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM17-211ENST00000481147 TMEM258P61165 79 aa6.82□□□□□ -1.32
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RBM17-211ENST00000481147 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM17-211ENST00000481147 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM17-211ENST00000481147 H7BZZ5 65 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM17-211ENST00000481147 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RBM17-211ENST00000481147 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM17-211ENST00000481147 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM17-211ENST00000481147 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.78□□□□□ -1.32
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RBM17-211ENST00000481147 C9orf92A6NGG3 77 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM17-211ENST00000481147 Q5W150 140 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM17-211ENST00000481147 A8MUU9 505 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM17-211ENST00000481147 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM17-211ENST00000481147 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM17-211ENST00000481147 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.74□□□□□ -1.33
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RBM17-211ENST00000481147 J3QL48 77 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM17-211ENST00000481147 FAM236CP0DP71 79 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM17-211ENST00000481147 Q75L30 129 aa6.71□□□□□ -1.34
RBM17-211ENST00000481147 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.71□□□□□ -1.34
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RBM17-211ENST00000481147 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.7□□□□□ -1.34
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RBM17-211ENST00000481147 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM17-211ENST00000481147 IGKV2-30P06310 120 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM17-211ENST00000481147 TNXBP22105 4242 aa6.68□□□□□ -1.34
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RBM17-211ENST00000481147 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RBM17-211ENST00000481147 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM17-211ENST00000481147 TPRXLQ17RH7 258 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM17-211ENST00000481147 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.62□□□□□ -1.35
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RBM17-211ENST00000481147 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.62□□□□□ -1.35
RBM17-211ENST00000481147 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.62□□□□□ -1.35
RBM17-211ENST00000481147 XP32Q5T750 250 aa6.61□□□□□ -1.35
RBM17-211ENST00000481147 HERC2O95714 4834 aa6.6□□□□□ -1.35
RBM17-211ENST00000481147 HRES1P13985 223 aa6.57□□□□□ -1.36
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RBM17-211ENST00000481147 A8MUN3 132 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM17-211ENST00000481147 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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RBM17-211ENST00000481147 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.41□□□□□ -1.38
RBM17-211ENST00000481147 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.4□□□□□ -1.38
RBM17-211ENST00000481147 V9GYY9 64 aa6.36□□□□□ -1.39
RBM17-211ENST00000481147 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM17-211ENST00000481147 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.33□□□□□ -1.4
RBM17-211ENST00000481147 Q1T7F1 81 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM17-211ENST00000481147 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM17-211ENST00000481147 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM17-211ENST00000481147 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM17-211ENST00000481147 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM17-211ENST00000481147 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM17-211ENST00000481147 LRP2P98164 4655 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM17-211ENST00000481147 LPAP08519 4548 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM17-211ENST00000481147 S4R3F8 94 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM17-211ENST00000481147 PRR15LQ9BU68 103 aa6.18□□□□□ -1.42
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